2014年長(zhǎng)沙市活禽市場(chǎng)污水中H5N1亞型禽流感病毒HA、NA及NS基因進(jìn)化分析
本文選題:活禽市場(chǎng) + 環(huán)境。 參考:《中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào)》2017年01期
【摘要】:目的分析2014年長(zhǎng)沙市活禽市場(chǎng)污水中H5N1亞型禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)血凝素(Hemagglutinin,HA)、神經(jīng)氨酸酶(Neuraminidase,NA)及非結(jié)構(gòu)蛋白(Non-structural,NS)基因進(jìn)化特征。方法從2014年長(zhǎng)沙市活禽市場(chǎng)采集501份環(huán)境標(biāo)本,利用Real-time PCR方法進(jìn)行A型、H5、H7和H9亞型流感病毒核酸檢測(cè),并對(duì)單一H5陽(yáng)性標(biāo)本進(jìn)行核苷酸測(cè)序,病毒HA、NA和NS基因測(cè)序結(jié)果進(jìn)行在線BLAST分析,利用Mega5和Bioedit軟件構(gòu)建核苷酸進(jìn)化樹(shù)和氨基酸(Amino acids,aa)比對(duì)。結(jié)果從501份環(huán)境標(biāo)本中檢出A型H5亞型病毒陽(yáng)性標(biāo)本177份(檢出率35.33%),其中8份標(biāo)本經(jīng)核苷酸測(cè)序鑒定為H5N1亞型病毒,進(jìn)化分析表明大部分H5N1病毒HA基因位于2.3.2分支內(nèi),聚集形成一個(gè)新亞分支,NA及NS基因位于2.3.2.1b亞分支。HA蛋白受體結(jié)合位點(diǎn)aa為QSG,表現(xiàn)為禽流感病毒受體特征;NA蛋白未出現(xiàn)H275Y及N295Saa替換,對(duì)神經(jīng)氨酸酶抑制劑敏感;HA、NA及NS蛋白關(guān)鍵分子位點(diǎn)表現(xiàn)為高致病性的分子特征。結(jié)論 2014年長(zhǎng)沙市活禽市場(chǎng)污水中H5N1亞型禽流感病毒HA、NA和NS基因表現(xiàn)為高致病性的分子特征,但不具有對(duì)人易感的受體特征,需要進(jìn)一步監(jiān)測(cè)。
[Abstract]:Objective to analyze the evolutionary characteristics of hemagglutinin (HA), neuraminidase (na) and non-structural protein (NNS) genes of H5N1 subtype avian influenza virus (Avian influenza virusus AIV) in the wastewater from live poultry market in Changsha City in 2014. Methods 501 environmental samples were collected from live poultry market in Changsha in 2014. Real-time PCR was used to detect the nucleic acid of influenza virus type A H5H7 and H9 subtype, and the nucleotide sequence of single H5 positive sample was sequenced. The results of Hana and NS gene sequencing were analyzed by blast on line. The nucleotide evolutionary tree and amino acid (Amino acidsof) were constructed by Mega5 and Bioedit software. Results 177 (35.33%) positive samples of H5 subtype A virus were detected from 501 environmental samples, 8 of them were identified as H5N1 subtype virus by nucleotide sequencing. Evolution analysis showed that most of the HA gene of H5N1 virus was located in the branch of 2.3.2. A new subbranch, na and NS gene, located at 2.3.2.1b subbranch. Ha protein receptor binding site AA was QSG. it was shown that there was no H275Y and N295Saa substitution in the Avian Influenza virus receptor characteristic. The key molecular sites of Hana and NS protein were highly pathogenicity to neuraminidase inhibitors. Conclusion the Hana and NS genes of H5N1 subtype avian influenza virus in Changsha live poultry market wastewater in 2014 are highly pathogenic, but they do not possess the receptor characteristics of susceptibility to human, and need to be monitored further.
【作者單位】: 長(zhǎng)沙市疾病預(yù)防控制中心;
【基金】:湖南省衛(wèi)生計(jì)生委2015年度科研計(jì)劃項(xiàng)目(B2015-153)
【分類號(hào)】:R511.7
【參考文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):2112801
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