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新疆褐牛基因外顯子多態(tài)性及其與SCS和泌乳性狀關(guān)聯(lián)性分析

發(fā)布時(shí)間:2018-07-10 01:52

  本文選題:新疆褐牛 + SCS; 參考:《中國農(nóng)業(yè)科學(xué)》2017年13期


【摘要】:【目的】探索ERAP2,Cwc27,PPFIBP2,THADA,ZNF804B和AMHR2基因多態(tài)性與新疆褐牛體細(xì)胞評(píng)分及泌乳性狀的相關(guān)性,旨在尋找與新疆褐牛體細(xì)胞評(píng)分及泌乳性狀相關(guān)的分子標(biāo)記!痉椒ā恳孕陆疄豸斈君R種牛場、新疆天山畜牧生物工程股份有限公司共169頭新疆褐牛母牛為試驗(yàn)對(duì)象,以2008—2015年間的生產(chǎn)性能測定記錄(包括乳脂率、乳蛋白率、總固體含量、乳糖率和體細(xì)胞計(jì)數(shù)等)和305 d產(chǎn)奶量為試驗(yàn)數(shù)據(jù),基于課題組前期15頭中國荷斯坦牛DNA混池重測序的結(jié)果篩選外顯子區(qū)域10個(gè)SNPs,采用基質(zhì)輔助激光電離飛行時(shí)間質(zhì)譜法(sequenom mass Array genotype)分型技術(shù)驗(yàn)證10個(gè)SNP位點(diǎn)的遺傳多態(tài)性,運(yùn)用SAS8.1軟件GLM過程對(duì)這10個(gè)SNP突變與新疆褐牛體細(xì)胞評(píng)分(SCS)、305 d產(chǎn)奶量、乳脂率、乳蛋白率、乳糖率和總固體的關(guān)聯(lián)程度進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析!窘Y(jié)果】10個(gè)SNP位點(diǎn)均具有多態(tài)性,χ~2檢驗(yàn)表明群體中9個(gè)SNP位點(diǎn)符合Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。關(guān)聯(lián)分析結(jié)果表明ERAP2基因兩個(gè)位點(diǎn)(T98741711C和G98736141A)均與新疆褐牛305 d產(chǎn)奶量達(dá)到極顯著關(guān)聯(lián)(P0.001),其中TT型和GG型個(gè)體的產(chǎn)奶量最高;PPFIBP2(C45667492G)位點(diǎn)與新疆褐牛乳糖率達(dá)到顯著關(guān)聯(lián)(P0.005),其中GG型個(gè)體的乳糖率最高;Cwc27(T14533269A)位點(diǎn)與新疆褐牛乳脂率和總固體含量達(dá)到顯著關(guān)聯(lián)(P0.005),與SCS達(dá)到極顯著關(guān)聯(lián)(P0.001),其中TT型個(gè)體的乳脂率和總固體含量均最高,AA型個(gè)體的SCS極顯著高于AT和TT型;AMHR2(C26758055G)位點(diǎn)與新疆褐牛乳蛋白率和總固體含量達(dá)到極顯著關(guān)聯(lián)(P0.001),其中GG型個(gè)體顯著高于CC和GC型個(gè)體。連鎖不平衡分析與單倍型構(gòu)建的結(jié)果發(fā)現(xiàn)10個(gè)SNPs構(gòu)建了兩個(gè)單倍型模塊,其中SNP1和SNP2位點(diǎn)之間處于連鎖不平衡狀態(tài)(r20.3),SNP4和SNP10位點(diǎn)之間處于強(qiáng)連鎖不平衡狀態(tài)(r20.6),隨后分析了單倍型與SCS和泌乳性狀之間的相關(guān)性,發(fā)現(xiàn)單倍型與新疆褐牛SCS和泌乳性狀無顯著關(guān)聯(lián)(P0.001)!窘Y(jié)論】初步發(fā)現(xiàn)了ERAP2,Cwc27,PPFIBP2和AMHR2與新疆褐牛SCS和泌乳性能相關(guān),結(jié)果可為新疆褐牛產(chǎn)奶性狀的分子標(biāo)記輔助選育提供參考和依據(jù)。
[Abstract]:[objective] to explore the relationship between the polymorphism of ZNF804B and AMHR2 gene of ERAP2Cwc27PPFIBP2THADAA ZNF804B and AMHR2 gene, and to search for molecular markers related to somatic score and lactation traits of Xinjiang brown cattle. [methods] A cattle farm in Urumqi, Xinjiang, was used to investigate the relationship between the polymorphism of ZNF804B and AMHR2 gene polymorphism and somatic cell score and lactation traits of Xinjiang Brown cattle. Xinjiang Tianshan Animal Husbandry and Bioengineering Co., Ltd., a total of 169 Xinjiang brown cattle cows as experimental objects, the production performance of 2008-2015 records (including milk fat rate, milk protein rate, total solid content, Lactose rate and somatic cell count, etc.) and 305d milk yield were the experimental data. Ten SNPs in exon region were screened based on the resequencing of 15 Chinese Holstein cattle. The genetic polymorphism of 10 SNPs was verified by matrix assisted laser ionization time of flight mass spectrometry (sequenom mass Array genotype) typing. The 10 SNP mutation and SCS 305d milk yield, milk fat rate, milk protein rate were analyzed by using the software GLM of SAS8.1. The correlation between lactose rate and total solids was statistically analyzed. [results] all 10 SNP loci were polymorphic. 蠂 ~ 2 test showed that 9 SNP loci in the population were in Hardy-Weinberg equilibrium state. The results of association analysis showed that the two ERAP2 loci (T98741711C and G98736141A) were significantly correlated with the milk yield of Xinjiang brown cattle (P0.001). The highest milk yield (PPFIBP2 (C45667492G) of the individuals with TT and GG type was significantly correlated with the lactose rate of Xinjiang brown cattle (P0.005). The highest lactose rate of GG individuals was Cwc27 (T14533269A), which was significantly correlated with milk fat rate and total solid content of Xinjiang brown cattle (P0.005), and with SCS (P0.001). The milk fat rate and total solid content of individuals with TT type were the highest in AA individuals. SCS was significantly higher than AT and TT type AMHR2 (C26758055G) loci in Xinjiang brown milk protein rate and total solid content (P0.001), among which GG type individuals were significantly higher than CC and GC type individuals. Linkage disequilibrium analysis and haplotype construction showed that 10 SNPs constructed two haplotype modules. There was strong linkage disequilibrium between SNP1 and SNP2 loci (r20.3) and between SNP4 and SNP10 loci (r20.6). The correlation between haplotypes and SCS and lactation traits was analyzed. It was found that there was no significant correlation between haplotypes and SCS and lactation traits (P0.001). [conclusion] it was found that ERAP2Cwc27 PPFIBP2 and AMHR2 were related to SCS and lactation performance of Xinjiang Brown cattle. The results could provide reference and basis for molecular marker assisted breeding of milk production traits of Xinjiang Brown cattle.
【作者單位】: 新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院;寧夏大學(xué)農(nóng)學(xué)院;新疆烏魯木齊種牛場;新疆天山畜牧生物工程股份有限公司;中國農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;
【基金】:“十二五”國家科技支撐計(jì)劃(2011BAD28B02) 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)(奶牛)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)資金(CARS-37)
【分類號(hào)】:S823

【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2111561

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