本文選題：豬鏈球菌型 + 表達譜芯片　； 參考：《江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué)》2017年06期

【摘要】：次黃嘌呤核苷酸脫氫酶(IMPDH)是豬鏈球菌2型的毒力相關(guān)因子,該基因的丟失降低了豬鏈球菌2型菌株ZY05719黏附HEp-2、PK15細(xì)胞的能力。為全面掌握IMPDH對ZY05719致病力的影響機制,采用定制的Agilent豬鏈球菌2型基因表達譜芯片,比較了親本菌株ZY05719(ZY)和impdh敲除菌株(ΔZY)的基因轉(zhuǎn)錄情況。結(jié)果顯示,impdh的丟失影響了254個基因的轉(zhuǎn)錄,其中包括impdh的下調(diào)基因177個,上調(diào)基因77個。對差異基因進行同類群聚類(Clusters of Orthologous Groups,COG)分析,顯示差異基因主要集中于氨基酸、碳水化合物的轉(zhuǎn)運代謝,以及核糖體、細(xì)胞壁、細(xì)胞膜的生物合成和防御機制。本研究較為全面地分析了impdh對豬鏈球菌2型基因轉(zhuǎn)錄譜的影響,為解釋impdh在豬鏈球菌致病中發(fā)揮的作用提供了數(shù)據(jù)支持。
[Abstract]:Hypoxanthine nucleotide dehydrogenase (IMPDH) is a virulence related factor of Streptococcus suis type 2. The loss of this gene reduces the ability of strain ZY05719 to adhere to HEp-2PK15 cells. In order to fully understand the mechanism of the pathogenicity of Agilent on ZY05719, the gene transcription of parent strain ZY05719 (ZY) and impdh knockout strain (螖 ZY) were compared by using a customized Agilent streptococcus suis type 2 gene expression microarray. The results showed that the loss of impdh affected the transcription of 254 genes, including 177 down-regulated genes and 77 up-regulated genes of impdh. The cluster of orthogonal groups cog (COG) analysis showed that differentially expressed genes mainly focus on amino acids, carbohydrate transport and metabolism, as well as ribosome, cell wall, cell membrane biosynthesis and defense mechanisms. In this study, the effect of impdh on the transcription profile of Streptococcus suis type 2 gene was analyzed, which provided data support for explaining the role of impdh in the pathogenicity of Streptococcus suis.
【作者單位】： 江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院獸醫(yī)研究所/農(nóng)業(yè)部獸用生物制品工程技術(shù)重點實驗室/國家獸用生物制品工程技術(shù)研究中心;
【基金】：公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項(編號:201303041) 江蘇省自主創(chuàng)新探索性研究項目(編號:CX[11]2060)
【分類號】：S852.611

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本文編號：2109867