發(fā)布時(shí)間：2018-07-07 23:36

  本文選題：大豆 + ABCG轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白��； 參考：《大豆科學(xué)》2017年04期

【摘要】：通過在大豆基因組數(shù)據(jù)庫中檢索擬南芥At ABCG40在大豆中的同源基因,獲得了Gm ABCG40基因序列。通過對(duì)Gm ABCG40基因編碼的氨基酸序列及啟動(dòng)子序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析,結(jié)果表明:Gm ABCG40基因CDS序列全長(zhǎng)4 284 bp,編碼1 427個(gè)氨基酸。Gm ABCG40編碼的蛋白為疏水性蛋白,具有多個(gè)N-糖基化位點(diǎn)、激酶磷酸化位點(diǎn)、N-豆蔻酰化位點(diǎn)、2個(gè)ATP/GTP結(jié)合位點(diǎn)基序A和1個(gè)速激肽家族信號(hào)。結(jié)構(gòu)域分析表明Gm ABCG40含有2個(gè)核苷酸結(jié)合域與2個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域,形成NBD1-TMD1-NBD2-TMD2結(jié)構(gòu),屬于ABCG亞家族的成員。Gm ABCG40預(yù)測(cè)的啟動(dòng)子區(qū)域含有與激素、脅迫、光應(yīng)答、胚乳表達(dá)和轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合相關(guān)的順式作用元件。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明Gm ABCG40與菜豆、紅豆、木豆、百脈根等豆科植物親緣關(guān)系較近。組織特異性表達(dá)分析結(jié)果顯示Gm DABCG40在葉片中表達(dá)量最低,在根中表達(dá)量最高,推測(cè)其可能參與根中ABA的轉(zhuǎn)運(yùn)過程。
[Abstract]:By searching the homologous genes of Arabidopsis thaliana at ABCG40 in soybean genome database, the Gm ABCG40 gene sequence was obtained. The amino acid sequence and promoter sequence of Gm ABCG40 gene were analyzed by bioinformatics. The results showed that the whole length of CDS sequence of Gm ABCG40 gene was 4 284 BP, and the protein encoding 1,427 amino acids. Gm ABCG40 was hydrophobic protein. There are many N-glycosylation sites, kinase phosphorylation sites, two ATP / GTP binding site motifs A and a tachykinin family signal. Domain analysis showed that Gm ABCG40 contained two nucleotide binding domains and two transmembrane domains, forming NBD1-TMD1-NBD2-TMD2 structure. Cis-acting elements associated with endosperm expression and transcription factor binding. Phylogenetic analysis showed that GM ABCG40 was closely related to bean, red bean, woody bean, Baimai root and other legume plants. The results of tissue specific expression analysis showed that GmDABCG40 was the lowest in the leaves and the highest in the root, suggesting that GmDABCG40 might be involved in the process of ABA transport in the root.
【作者單位】： 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院/大豆生物學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;黑龍江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所;
【基金】：黑龍江普通本科高等學(xué)校青年創(chuàng)新人才培養(yǎng)計(jì)劃(UNPYSCT-2016005) 抗逆轉(zhuǎn)基因大豆新品培育(2016ZX0804002)
【分類號(hào)】：S565.1

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2106655