鐵皮石斛DoMAPK5基因的克隆及表達(dá)特征分析
本文選題:鐵皮石斛 + 促分裂原蛋白激酶 ; 參考:《時珍國醫(yī)國藥》2016年02期
【摘要】:目的克隆及分析鐵皮石斛DoMAPK5基因的表達(dá)特征。方法利用cDNA末端快速克隆技術(shù)(RACE),首次從鐵皮石斛接菌共生萌發(fā)種子中分離得到1個新的MAPK基因,對其編碼蛋白的理化性質(zhì)、保守結(jié)構(gòu)域等特征及進(jìn)行了分析。并應(yīng)用熒光定量PCR對DoMAPK5基因在石斛不同組織中表達(dá)模式分析。結(jié)果 DoMAPK5基因(Gen Bank注冊號KJ472788),全長為2184bp、編碼一條597個氨基酸的肽鏈,預(yù)測分子量為67.39KDa,等電點(diǎn)為9.28,編碼的蛋白均不含信號肽,在210-232位具有23個氨基酸的跨膜域,具有MAPK蛋白家族保守的絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶的結(jié)構(gòu)域及MAPK位點(diǎn)。序列比對及系統(tǒng)發(fā)育樹分析結(jié)果表明DoMAPK5基因與葡萄MAPK基因均具有很高的相似性(82%),與水稻MAPK10親緣關(guān)系最近。應(yīng)用熒光定量PCR對DoMAPK5基因在石斛不同組織中表達(dá)模式分析顯示,該基因在未接菌的植物組織中屬組成型表達(dá),在接菌共生萌發(fā)的植物組織中顯著上調(diào),為未萌發(fā)種子的10.49倍。結(jié)論 DoMAPK5在植物組織中屬于組成型表達(dá),具有受菌根真菌誘導(dǎo)表達(dá)的特征。
[Abstract]:Objective to clone and analyze the expression of DoMAPK5 gene in Dendrobium candidum. Methods A new MAPK gene was isolated from the seeds of Dendrobium candidum by cDNA terminal rapid cloning (race) for the first time. The physicochemical properties, conserved domain and other characteristics of the encoded protein were analyzed. The expression patterns of DoMAPK5 gene in different tissues of Dendrobium candidum were analyzed by fluorescence quantitative PCR. Results DoMAPK5 gene (GenBank registration number KJ472788) was 2184bp. it encodes a peptide chain of 597 amino acids. The predicted molecular weight is 67.39 KDa. the isoelectric point is 9.28, and the encoded protein contains no signal peptide and has 23 amino acid transmembrane domains at 210-232 sites. The domain and MAPK site of serine / threonine protein kinase were conserved by MAPK family. Sequence alignment and phylogenetic tree analysis showed that there was a high similarity between DoMAPK5 gene and grape MAPK gene (82%), and the relationship between DoMAPK5 gene and rice MAPK10 was the closest. The expression patterns of DoMAPK5 gene in different tissues of Dendrobium candidum were analyzed by fluorescence quantitative PCR. The results showed that the expression of DoMAPK5 gene in non-inoculated plant tissues was constitutively expressed, and was significantly up-regulated in inoculated symbiotic germinating plant tissues, 10.49 times as much as that of non-germinated seeds. Conclusion DoMAPK5 is constitutively expressed in plant tissues and is induced by mycorrhizal fungi.
【作者單位】: 北華大學(xué)醫(yī)學(xué)部;中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院藥用植物研究所;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(No.31170314) 國家教育部博士點(diǎn)基金項目(No.20131106130002)
【分類號】:S567.239
【參考文獻(xiàn)】
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【共引文獻(xiàn)】
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,本文編號:2082172
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