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番茄PIN2基因的生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-06-29 02:47

  本文選題:番茄 + PIN基因 ; 參考:《分子植物育種》2017年07期


【摘要】:PIN基因家族是調(diào)控生長(zhǎng)素運(yùn)輸?shù)闹匾敵鲚d體。擬南芥PIN2介導(dǎo)的生長(zhǎng)素極性運(yùn)輸在生長(zhǎng)素不對(duì)稱分布在根的向重力性反應(yīng)中起著關(guān)鍵性調(diào)控作用(潘建偉等,2010)。植物根系的重力性決定著根系空間生長(zhǎng)的趨勢(shì),對(duì)植物養(yǎng)分的吸收有著重要的影響。本研究選擇功能已知的擬南芥PIN2基因?yàn)閰⒖夹蛄?對(duì)番茄PIN2基因開展了蛋白組分和理化性質(zhì),系統(tǒng)進(jìn)化分析,蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè),跨膜結(jié)構(gòu)分析等生物信息學(xué)研究,為番茄PIN2基因的生物學(xué)功能及分子機(jī)理提供理論基礎(chǔ)。
[Abstract]:PIN gene family is an important output vector regulating auxin transport. PIN2-mediated polar transport of auxin in Arabidopsis thaliana plays a key role in the asymmetric distribution of auxin in the root gravity response (Pan Jianwei et al. 2010). The gravity of plant roots determines the trend of root space growth and has an important effect on plant nutrient absorption. In this study, the PIN2 gene of Arabidopsis thaliana was selected as the reference sequence. The protein composition and physicochemical properties, phylogenetic analysis, protein structure prediction and transmembrane structure analysis of tomato PIN2 gene were studied in bioinformatics. It provides a theoretical basis for the biological function and molecular mechanism of tomato PIN2 gene.
【作者單位】: 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝園林學(xué)院;東北農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)部東北地區(qū)園藝作物生物學(xué)與種質(zhì)創(chuàng)制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系專項(xiàng)基金(CARS-25-A-15) 國(guó)家自然科學(xué)基金(31272171) 黑龍江省大宗蔬菜新品種選育(GA15B103)項(xiàng)目 農(nóng)業(yè)部東北地區(qū)園藝作物生物學(xué)與種質(zhì)創(chuàng)制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放課題基金項(xiàng)目共同資助
【分類號(hào)】:Q943.2;S641.2

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2080494

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