本文選題：乳腺癌 + 易感基因��； 參考：《天津醫(yī)科大學(xué)》2017年碩士論文

【摘要】：目的:遺傳性乳腺癌約占全部乳腺癌總數(shù)的5%-10%。乳腺癌易感基因BRCA1/2的致病性胚系突變與遺傳性乳腺癌的發(fā)生密切相關(guān)。同時(shí),更多的高外顯率癌癥易感基因參與到乳腺癌癌變過(guò)程中。本研究通過(guò)二代測(cè)序技術(shù)篩檢了6個(gè)高外顯率乳腺癌易感基因(BRCA1、BRCA2、PTEN、TP53、STK11、BAP1)的全外顯子區(qū)域,以檢測(cè)6個(gè)基因的胚系突變,并評(píng)估其與乳腺癌患者臨床病理特征之間的關(guān)系。方法:通過(guò)Illumina Miseq測(cè)序平臺(tái),采用二代測(cè)序技術(shù),設(shè)計(jì)基于擴(kuò)增子的靶向測(cè)序panel用來(lái)富集6個(gè)高外顯率乳腺癌易感基因的全部外顯子區(qū)域。收集自2013年11月到2015年7月天津醫(yī)科大學(xué)腫瘤醫(yī)院接診的146例乳腺癌患者,71例乳腺癌高危人群及55例健康人群的外周血DNA樣本并對(duì)其進(jìn)行檢測(cè)。根據(jù)檢測(cè)結(jié)果,評(píng)估該6個(gè)基因的胚系突變與乳腺癌患者臨床病理特征之間的關(guān)系。結(jié)果:1.本研究利用基于擴(kuò)增子的靶向測(cè)序panel進(jìn)行多基因測(cè)序,全部目標(biāo)區(qū)域平均測(cè)序深度為587x。92%的樣本獲得測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量Q30超過(guò)80%。在所有樣本中,超過(guò)85%的讀段可定位到目標(biāo)區(qū)域,平均百分比為89.7%。測(cè)序數(shù)據(jù)覆蓋了95%以上的目標(biāo)外顯子區(qū)域,平均覆蓋率為98.1%。擴(kuò)增子在不同樣本之間的測(cè)序深度具有良好的可重復(fù)性且不同擴(kuò)增子測(cè)序數(shù)據(jù)分布具有高度的一致性。2.總共鑒定出67個(gè)突變位點(diǎn),包括50個(gè)錯(cuò)義突變,8個(gè)無(wú)義突變和9個(gè)插入缺失突變。其中21個(gè)(31.3%)突變位點(diǎn)未在Ex AC、Clin Var和db SNP數(shù)據(jù)庫(kù)中報(bào)道過(guò),被視為新發(fā)現(xiàn)的突變。85.1%(57/67)的突變僅存在于乳腺癌患者和高危人群中。67個(gè)突變位點(diǎn)中存在37個(gè)高風(fēng)險(xiǎn)致病性胚系突變。3.乳腺癌患者中是否攜帶胚系突變與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移狀態(tài)、TNM分期相關(guān),差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。而在患者年齡、惡性腫瘤家族史、組織學(xué)分級(jí)以及ER、PR、Her-2、Ki67表達(dá)、分子分型等方面無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P0.05)。在突變陽(yáng)性的乳腺癌患者中,是否攜帶致病性突變與惡性腫瘤家族史和三陰性表型相關(guān),差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05),而在年齡、區(qū)域淋巴結(jié)狀態(tài)、TNM分期、組織學(xué)分級(jí)以及ER、PR、Her-2、Ki67表達(dá)方面未見統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P0.05)。結(jié)論:1.本研究證明了通過(guò)二代測(cè)序技術(shù)利用基于擴(kuò)增子的靶向測(cè)序panel篩選乳腺癌相關(guān)基因胚系突變的可行性和實(shí)用性。此技術(shù)為我們提供了一種評(píng)估乳腺癌遺傳風(fēng)險(xiǎn)的方法。2.通過(guò)本研究,發(fā)現(xiàn)了一些新的突變,擴(kuò)展了乳腺癌易感基因胚系突變譜,但是這些突變對(duì)乳腺癌遺傳風(fēng)險(xiǎn)及預(yù)后的影響需要進(jìn)一步地研究驗(yàn)證。3.攜帶乳腺癌易感基因胚系突變的乳腺癌患者更容易發(fā)生淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,且TNM分期更高,提示預(yù)后較差。4.攜帶致病性胚系突變的乳腺癌患者存在惡性腫瘤家族史的比例更高,表明其具有較高的乳腺癌遺傳風(fēng)險(xiǎn)。同時(shí)其更易表現(xiàn)為三陰性表型,為三陰性乳腺癌患者的診療提供了新的見解。
[Abstract]:Objective : To investigate the relationship between the susceptibility gene of breast cancer and the clinical pathological characteristics of breast cancer patients . The results showed that there were 67 mutation sites , including 50 missense mutations , 8 nonsense mutations and 9 insertion deletion mutations . 1 . This study has proved the feasibility and practicability of screening breast cancer related gene germ line mutation by using the target sequencing panel based on amplification by the second generation sequencing technology . This technique provides us a new method for assessing the genetic risk of breast cancer .
【學(xué)位授予單位】：天津醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：R737.9

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前3條

1 丁淑云;袁斌;王欣;胡珀;;BRCA1/2基因相關(guān)乳腺癌臨床用藥進(jìn)展[J];中國(guó)新藥與臨床雜志;2015年03期

2 王嵬;陳曲;哈敏文;;BRCA-1在三陰性乳腺癌中的表達(dá)與含鉑方案化療敏感性的臨床研究[J];中國(guó)醫(yī)藥指南;2014年25期

3 HONG HuiXiao;ZHANG WenQian;SHEN Jie;SU ZhenQiang;NING BaiTang;HAN Tao;PERKINS Roger;SHI LeMing;TONG WeiDa;;Critical role of bioinformatics in translating huge amounts of next-generation sequencing data into personalized medicine[J];Science China(Life Sciences);2013年02期

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本文編號(hào)：2064777