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珠子參β-香樹素合成酶基因的克隆和生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-06-24 11:24

  本文選題:珠子參 + β-香樹素合成酶; 參考:《生物技術(shù)通報(bào)》2017年02期


【摘要】:β-香樹素合成酶(beta-amyrin synthaseβAS)是定向分流齊墩果烷型皂苷和達(dá)瑪烷型皂苷的限速酶,對(duì)藥用植物三萜皂苷的生物合成具有重要的調(diào)控作用;谥樽訁⑥D(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中βAS轉(zhuǎn)錄本序列設(shè)計(jì)引物,利用RT-PCR方法從珠子參根狀莖中克隆得到βAS基因全長c DNA序列,命名為pjβAS。經(jīng)測序鑒定該基因長度為2 655 bp,包含一個(gè)2 286 bp的完整開放閱讀框,編碼761個(gè)氨基酸,在Gen Bank數(shù)據(jù)庫的登錄號(hào)為KX254566。生物信息學(xué)分析顯示,其編碼蛋白分子量為87.90 k D,理論等電點(diǎn)(p I)5.84,不含跨膜區(qū),為非分泌蛋白,含有38處磷酸化位點(diǎn),主要于葉綠體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中發(fā)揮生理作用;二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測發(fā)現(xiàn)其α-螺旋占39.82%、延伸鏈16.56%、β-轉(zhuǎn)角10.38%、無規(guī)則卷曲33.24%,具有DCTAE、QW(QXXXXXW)和MWCRCY3個(gè)氧化鯊烯環(huán)化酶(OCS)基因家族特征保守基序;pjβAS蛋白與竹節(jié)參(AKN23431.1)序列的一致性為100%,系統(tǒng)進(jìn)化分析中與竹節(jié)參(AKN23431.1)、西洋參(AGG09939.1)、柴胡(ABY90140.2)劃為同一分支。通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析pjβAS在珠子參不同組織中的相對(duì)表達(dá)量,發(fā)現(xiàn)pjβAS基因在花、葉、莖、根狀莖中均有表達(dá),在葉中表達(dá)量最高,根狀莖中表達(dá)量最低。
[Abstract]:尾 -vanillin synthase (beta-amyrin synthase 尾 -AS) is a rate-limiting enzyme that distributes Oleanolic saponins and damarane saponins, and plays an important role in regulating the biosynthesis of triterpenoid saponins in medicinal plants. Based on the 尾 -AS transcriptional sequence of Panax japonicus, the full-length cDNA sequence of 尾 -AS gene was cloned from the rhizome of Panax japonicus by RT-PCR and named as pj 尾 ASs. The length of the gene was 2 655 BP, which contained a complete open reading frame of 2 286 BP encoding 761 amino acids. The accession number in GenBank database was KX254566. Bioinformatics analysis showed that the molecular weight of the encoded protein was 87.90 KD, the theoretical isoelectric point (Pi) was 5.84, no transmembrane region, it was a non-secretory protein, and it contained 38 phosphorylation sites, which mainly played a physiological role in chloroplast and endoplasmic reticulum. The secondary structure prediction found that the 偽 -helix occupies 39.82%, the extension chain 16.56, the 尾 -turn 10.38, the irregular crimp 33.240.There is DCTAEEQW (QXXXXXW) and MWCRCY3 family of oxidative squalene cyclase (OCS) genes. The conserved motif pj 尾 -AS is 100 and the sequence of AKN23431.1 is consistent with the sequence of the family of three oxidative squalene cyclase (OCS) genes of DCTAEEQW (QXXXXXW) and MWCRCYs (AKN23431.1). It is classified as the same branch as Radix Bamboo (AKN23431.1), Panax quinquefolium (AGG09939.1) and Bupleurum chinense (ABY90140.2). The relative expression of pj 尾 as in different tissues of Radix Ginseng was analyzed by real-time fluorescence quantitative PCR. It was found that the expression of pj 尾 as gene was found in flowers, leaves, stems and rhizomes, the highest in leaves and the lowest in rhizomes.
【作者單位】: 武漢輕工大學(xué)生物與制藥工程學(xué)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(81274023)
【分類號(hào)】:S567.53

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本文編號(hào):2061356

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