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人參中苯甲酸脅迫響應(yīng)基因WRKY7的克隆與表達(dá)分析

發(fā)布時間:2018-06-23 04:27

  本文選題:人參 + WRKY轉(zhuǎn)錄因子; 參考:《中國中藥雜志》2017年06期


【摘要】:WRKY轉(zhuǎn)錄因子是高等植物中最重要的轉(zhuǎn)錄因子基因家族之一,其在植物形態(tài)建成、生長發(fā)育以及應(yīng)對生物(病菌、害蟲等)、非生物(干旱、鹽、冷、熱等)脅迫過程中發(fā)揮重要作用。該研究根據(jù)人參化感自毒物質(zhì)苯甲酸誘導(dǎo)的人參轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),設(shè)計全長擴(kuò)增引物,利用RT-PCR方法獲得1條編碼WRKY轉(zhuǎn)錄因子的基因,暫命名為WRKY7,并對其進(jìn)行TA克隆、測序和序列分析。該基因cDNA全長1 216 bp,其開放閱讀框(open reading frame,ORF)為1 014 bp,編碼337個氨基酸。序列分析及系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,該蛋白屬于WRKY家族第Ⅲ類成員,與西洋參種的WRKY6轉(zhuǎn)錄因子親緣關(guān)系最近,同源性為87%。實時熒光定量PCR分析發(fā)現(xiàn),苯甲酸脅迫后WRKY7的表達(dá)量顯著升高,推測該基因可能參與了人參響應(yīng)苯甲酸脅迫的過程,為進(jìn)一步研究人參自毒脅迫響應(yīng)的分子機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:WRKY transcription factor is one of the most important transcription factor gene families in higher plants, it is in plant morphogenesis, growth and development and response to biological (bacteria, pests, etc.), abiotic (drought, salt, cold, etc.), Heat) plays an important role in the process of stress. In this study, based on panax ginseng transcriptome data induced by benzoic acid, a novel gene encoding WRKY transcription factor was obtained by RT-PCR, which was tentatively named WRKY7 and cloned by TA. Sequencing and sequence analysis. The total length of the cDNA is 1 216 BP, and the open reading frame (open reading frame ORF is 1 014 BP, encoding 337 amino acids. Sequence analysis and phylogenetic analysis showed that the protein belonged to the third class member of WRKY family and had the closest relationship with WRKY6 transcription factor of Panax quinquefolium with a homology of 87g. Real-time fluorescence quantitative PCR analysis showed that the expression of WRKY7 was significantly increased after benzoic acid stress, which suggested that the gene might be involved in the process of ginseng response to benzoic acid stress, which laid a foundation for further study on the molecular mechanism of ginseng autotoxic stress response.
【作者單位】: 中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院藥用植物研究所;
【基金】:國家自然科學(xué)基金項目(81373911) 中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)與健康科技創(chuàng)新工程項目(2016-I2M-3-017)
【分類號】:S567.51

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級參考文獻(xiàn)】

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本文編號:2055766

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