本文選題：野生種花生 + 鈣依賴蛋白激酶��； 參考：《熱帶作物學(xué)報》2017年01期

【摘要】：Ca2+是植物中重要的第二信使,幾乎介導(dǎo)了植物生長發(fā)育的全部反應(yīng)。鈣依賴蛋白激酶(CDPKs)是植物中重要的鈣傳感蛋白,在植物生命活動中扮演著重要角色。目前2個二倍體野生種花生全基因組序列已經(jīng)公布,而由2個野生種雜交后形成的異源四倍體栽培種花生的全基因組序列還沒有公布,野生種花生CDPKs的生物信息學(xué)分析結(jié)果可以為栽培種花生CDPKs的研究提供參考。本研究采用生物信息學(xué)方法和工具對2個野生種花生CDPKs基因家族的全基因組分布、基因結(jié)構(gòu)、進(jìn)化和理化性質(zhì)等進(jìn)行分析。結(jié)果表明:2個野生種花生全基因組均比對到35個CDPKs基因序列,野生種花生與擬南芥CDPKs基因結(jié)構(gòu)類似,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)具有典型的蛋白質(zhì)激酶和EF手型結(jié)構(gòu)域,2個野生種花生與其它物種在進(jìn)化過程中CDPKs變異較小,可能作為鈣傳感蛋白在細(xì)胞內(nèi)各個部位和細(xì)胞器中行使功能。本研究結(jié)果可為栽培種花生的CDPKs結(jié)構(gòu)和功能研究提供參考。
[Abstract]:CA 2 is an important second messenger in plants, which mediates almost all the responses to plant growth and development. Calcium dependent protein kinase (CDPKs) is an important calcium sensing protein in plants and plays an important role in plant life. At present, the whole genome sequence of two diploid wild species peanut has been published, but the whole genome sequence of allotetraploid peanut has not been published. The bioinformatics analysis results of the wild peanut CDPKs can provide reference for the study of the cultivated peanut CDPKs. In this study, bioinformatics methods and tools were used to analyze the whole genome distribution, gene structure, evolution and physicochemical properties of CDPKs gene family of two wild species of peanut. The results showed that there were 35 CDPKs gene sequences in the whole genome of two wild species of peanut, and the structure of CDPKs gene in wild species was similar to that in Arabidopsis thaliana. The protein structure has typical protein kinase and EF hand domain. The variation of CDPKs between two wild species peanut and other species is relatively small during the evolution, which may act as a calcium sensing protein in various parts of the cell and organelles. The results of this study can be used as a reference for the study of the structure and function of CDPKs in peanut cultivars.
【作者單位】： 中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院椰子研究所;海南省熱帶油料作物生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;廣西農(nóng)業(yè)科學(xué)院經(jīng)濟(jì)作物研究所;
【基金】：海南省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.20163144)
【分類號】：S565.2

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本文編號：2027002