奶牛乳腺炎無乳鏈球菌菌毛島嶼PI-2a骨架蛋白BP基因的克隆及其抗原性預測
本文選題:無乳鏈球菌 + 菌毛島嶼。 參考:《中國病原生物學雜志》2017年04期
【摘要】:目的克隆奶牛乳腺炎無乳鏈球菌菌毛島嶼BP基因片段并進行序列分析。方法根據(jù)GenBank已公布牛源無乳鏈球菌菌毛島嶼PI-2a的BP基因序列,采用Primer 5.0軟件設計1對特異性引物,以內(nèi)蒙古通遼地區(qū)分離的乳源性無乳鏈球菌臨床菌株總DNA為模板PCR擴增BP基因片段,并進行生物信息學分析。結(jié)果克隆的BP基因序列大小為609bp,編碼203個氨基酸殘基,其基因序列與GenBank上公布的牛源無乳鏈球菌菌毛島嶼PI-2a的BP基因(EU930008)相似性為100%。菌毛島嶼骨架蛋白BP二級結(jié)構(gòu)的α螺旋在N端分布較多;β折疊較豐富,且分布于C端較多;無規(guī)則卷曲分布較均勻。菌毛島嶼骨架蛋白BP的親水區(qū)分布較廣,遍布于整個多肽區(qū),屬于親水性蛋白。BP蛋白分子表面可及性較高,區(qū)域占比達57.0%,且抗原性較好。結(jié)論奶牛乳腺炎無乳鏈球菌菌毛骨架蛋白BP基因具有高度保守性,其編碼蛋白具有良好的抗原性,可作為防治無乳鏈球菌性乳腺炎的候選抗原序列。
[Abstract]:Objective to clone and sequence the BP gene of Streptococcus lactis in dairy cow mastitis. Methods A pair of specific primers were designed by using Primer 5.0 software according to the BP gene sequence of PI-2a isolated from Streptococcus lactococcus pili from cattle, which had been published in GenBank. The BP gene fragment was amplified by PCR from the total DNA of Streptococcus lactogenus isolated from Tongliao area of Inner Mongolia and analyzed by bioinformatics. Results the sequence size of the cloned BP gene was 609bp, encoding 203 amino acid residues. The similarity between the BP gene sequence of the cloned BP gene and the BP gene EU930008 of PI-2a, a non-lactobacillus pili island published in GenBank, was 100. The 偽 -helix of BP secondary structure was more in N-terminal, 尾 -fold was abundant and distributed more in C-terminal, and the irregular curl distribution was more uniform. The hydrophilic region of bacterial island skeleton protein BP was widely distributed, and it was found in the whole polypeptide region. It belongs to the hydrophilic protein .BP protein with high surface accessibility, accounting for 57.0% of Prida and having good antigenicity. Conclusion BP gene is highly conserved and its coding protein has good antigenicity. It can be used as a candidate antigen sequence for prevention and treatment of streptococcal mastitis.
【作者單位】: 內(nèi)蒙古民族大學生命科學學院;內(nèi)蒙古自治區(qū)乳源性致病菌防控工程技術研究中心;內(nèi)蒙古民族大學乳源性致病菌研究所;山東省濱州畜牧獸醫(yī)研究院;
【基金】:國家自然科學基金項目(No.31560689) 內(nèi)蒙古自治區(qū)乳源性致病菌防控工程技術研究中心開放課題(No.MDK2016036)
【分類號】:S852.61
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,本文編號:2008241
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