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西瓜CBL家族基因的鑒定與特征分析

發(fā)布時(shí)間:2018-06-09 15:17

  本文選題:西瓜 + CBL基因; 參考:《北方園藝》2017年15期


【摘要】:CBL基因在植物逆境應(yīng)答過程中具有重要作用,但在西瓜作物的抗逆育種研究中鮮有相關(guān)報(bào)道。該研究利用生物信息學(xué)的分析方法從已發(fā)表的西瓜全基因組中鑒定出7個(gè)CBL基因(ClaCBL1~ClaCBL7),并分析了它們在全基因組范圍內(nèi)的分布情況、分子結(jié)構(gòu)特征、順式元件以及系統(tǒng)進(jìn)化等基本特征,為進(jìn)一步研究西瓜CBL基因的功能提供參考。結(jié)果表明:西瓜CBL基因在全基因組中的分布是不均勻的,其中僅ClaCBL4基因有9個(gè)外顯子,其余基因均為8個(gè)外顯子,編碼區(qū)序列大小在639~738bp。在進(jìn)化上西瓜CBL基因分為3個(gè)不同的類群;它們編碼區(qū)域內(nèi)的氨基酸序列均含有能與CIPK互作的FSPF高保守性位點(diǎn)及能與鈣離子結(jié)合的3個(gè)EF-hand結(jié)構(gòu);除了ClaCBL1預(yù)測定位在胞外基質(zhì)中,其余的ClaCBL定位在細(xì)胞內(nèi)的不同部位;在西瓜CBL基因啟動(dòng)子上游的序列中存在多個(gè)應(yīng)答不同逆境和植物激素的順式元件,而且CBL家族不同成員基因含有的順式元件的種類和數(shù)目各不相同。上述分析顯示,西瓜CBL可能參與多種生物學(xué)過程,而且不同成員存在功能上的分化。
[Abstract]:The results showed that the distribution of CBL4 gene was non - uniform in the whole genome . The results showed that there were 9 exons and 3 EF - hand structures in the whole genome of watermelon .
【作者單位】: 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝園林學(xué)院農(nóng)業(yè)部東北地區(qū)園藝作物生物學(xué)與種質(zhì)創(chuàng)制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國家自然科學(xué)基金面上資助項(xiàng)目(31572144) 國家西甜瓜產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系-分子育種崗位資助項(xiàng)目(CARS-26-02)
【分類號(hào)】:S651

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本文編號(hào):2000169

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