本文選題：棉花 + 鹽脅迫　； 參考：《江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報》2017年06期

【摘要】：LTR-反轉(zhuǎn)座子是棉花基因組的主要組成部分,在基因組中通常呈現(xiàn)"靜止"狀態(tài)。但受到脅迫刺激時,部分反轉(zhuǎn)座子的轉(zhuǎn)錄活性可被"激活",可能影響鄰近基因的表達(dá)。本研究在鹽脅迫下通過生物信息學(xué)手段,在旱地棉轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中檢測到3 885個轉(zhuǎn)錄激活的候選LTR-反轉(zhuǎn)座子;這些候選LTR-反轉(zhuǎn)座子上下游5 kb內(nèi)共有1 787個鄰近基因,其中377個鄰近基因在鹽脅迫下差異表達(dá),通過對377個基因進(jìn)行功能注釋發(fā)現(xiàn),326個基因注釋到GO數(shù)據(jù)庫中,并且部分基因與棉花已報道過的耐鹽抗旱基因同源。本研究結(jié)果將為棉花的耐鹽分子機(jī)理解析提供一定的理論基礎(chǔ)。
[Abstract]:LTR- retrotransposon is the main component of cotton genome, in which it is usually "stationary". However, the transcriptional activity of some retrotransposons can be "activated" when stimulated by stress, which may affect the expression of adjacent genes. In this study, 3,885 candidate LTR-retrotransposons for transcriptional activation were detected by bioinformatics in upland cotton transcriptome database under salt stress, and there were 1,787 adjacent genes in the upstream and downstream 5kb of these candidate LTR-retrotransposons. 377 adjacent genes were differentially expressed under salt stress, 326 genes were found in go database by functional annotation of 377 genes, and some genes were homologous to the previously reported genes of salt tolerance and drought resistance in cotton. The results of this study will provide a theoretical basis for the molecular mechanism analysis of salt tolerance in cotton.
【作者單位】： 南通大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院經(jīng)濟(jì)作物研究所/農(nóng)業(yè)部長江下游棉花和油菜重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：江蘇省科技項(xiàng)目(BK20150540) 國家轉(zhuǎn)基因生物新品種培育重大專項(xiàng)(2014ZX08005-004-002) 江蘇省農(nóng)業(yè)科技自主創(chuàng)新基金項(xiàng)目[CX(14)5008]
【分類號】：S562

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本文編號：1993267