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青花菜鋅指蛋白基因BoCCCH1的克隆和表達分析

發(fā)布時間:2018-06-07 08:56

  本文選題:CCCH鋅指蛋白 + 霜霉病。 參考:《核農(nóng)學報》2016年03期


【摘要】:CCCH鋅指蛋白廣泛存在于真核生物中,在植物的生長、發(fā)育和逆境脅迫響應中起著重要作用。為獲知青花菜CCCH轉(zhuǎn)錄因子基因的序列特征和表達特性,從青花菜葉片中克隆到1個CCCH基因,命名為Bo CCCH1,同時,利用RT-PCR方法研究了其在不同器官及霜霉菌侵染葉片中的表達模式。序列分析結(jié)果表明,Bo CCCH1的基因組全長為1 568 bp,包含1個長度為599 bp的內(nèi)含子,2個長度分別為627 bp、342 bp的外顯子,編碼322個氨基酸,蛋白質(zhì)的分子量與等電點分別為35 296.42 Da和8.47;Bo CCCH1有2個鋅指結(jié)構(gòu),類型均為C-X8-C-X5-C-X3-H。系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果表明,Bo CCCH1與其它植物的21條同源序列在進化樹上分為6組,來自十字花科的CCCH與Bo CCCH1處于同一分支;虮磉_結(jié)果表明,Bo CCCH1在葉、花莖、嫩角果、花蕾和花中表達,其中花莖和嫩角果的表達量最高,但在根中未檢測到表達;在霜霉菌侵染下,葉片Bo CCCH1的表達量升高,到24 h和36 h時達到最大,推測Bo CCCH1與霜霉病抗性相關(guān)。本研究為進一步探明Bo CCCH1在霜霉病抗性反應中的功能奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:Zinc finger protein (CCCH) is widely found in eukaryotes and plays an important role in plant growth, development and stress response. In order to know the sequence and expression characteristics of CCCH transcription factor gene in broccoli, a CCCH gene named Bo CCCH1 was cloned from cauliflower leaves. The expression patterns of CCCH gene in different organs and infected leaves were studied by RT-PCR method. Sequence analysis showed that the genome of Bo CCCH1 was 1 568 BP in length, including one intron with 599 BP in length and two exons with a length of 627 BP, encoding 322 amino acids. The molecular weight and isoelectric point of the protein are 35 296.42 Da and 8. 47% Bo CCCH1, respectively, with two zinc-finger structures, all of which are C-X8-C-X5-C-X3-H. Phylogenetic analysis showed that the 21 homologous sequences of Bo CCCH1 and other plants were divided into 6 groups in the evolutionary tree, and CCCH from Cruciferae and Bo CCCH1 were in the same branch. The results of gene expression showed that Bo CCCH1 was expressed in leaves, stems, tender kernels, buds and flowers, among which the highest expression was found in stems and tender pods, but no expression was detected in roots. At 24 h and 36 h, the highest value was obtained, which suggested that Bo CCCH1 was associated with downy mildew resistance. This study laid a foundation for further exploring the function of Bo CCCH1 in downy mildew resistance response.
【作者單位】: 臺州學院生命科學學院/生態(tài)學浙江省重點學科;麗水學院生態(tài)學院;
【基金】:浙江省本科院校中青年學科帶頭人學術(shù)攀登項目(pd2013420) 浙江省自然科學基金項目(LY13C150003) 浙江省重點學科(浙江省臺州學院生態(tài)學)開放課題(EKD2013-03)
【分類號】:S635.3

【共引文獻】

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【二級參考文獻】

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本文編號:1990605


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