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鹽生植物四翅濱藜Actin基因片段的克隆及表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-06-01 12:28

  本文選題:四翅濱藜 + 肌動(dòng)蛋白 ; 參考:《草業(yè)科學(xué)》2017年03期


【摘要】:在研究植物功能基因表達(dá)模式中肌動(dòng)蛋白(Actin)編碼基因是最常用的內(nèi)參基因之一。本研究根據(jù)藜科植物Actin基因編碼區(qū)保守序列設(shè)計(jì)一對(duì)簡(jiǎn)并引物,以鹽生植物四翅濱藜(Atriplex canescens)4周齡幼苗葉片的總RNA為模板,采用逆轉(zhuǎn)錄PCR(reverse transcription PCR,RT-PCR)方法擴(kuò)增出Actin基因片段并連接到pMD19-T載體上,所得陽(yáng)性克隆經(jīng)PCR檢測(cè)后進(jìn)行測(cè)序。序列分析結(jié)果表明,該基因片段長(zhǎng)度為598bp,編碼198個(gè)氨基酸;該序列與Genbank中登錄的高等植物Actin基因核苷酸序列同源性在84%以上,氨基酸序列同源性在94%以上。說(shuō)明其為Actin基因片段,具有高度保守性,命名為AcACT。序列進(jìn)化分析顯示,AcACT與甜菜(Beta vulgaris)和堿蓬(Suaeda glauca)肌動(dòng)蛋白編碼基因的親緣關(guān)系最近。熒光定量PCR分析結(jié)果表明,AcACT在鹽處理下各組織中的表達(dá)量恒定。表明AcACT可作為內(nèi)參基因來(lái)研究四翅濱藜耐鹽相關(guān)基因的表達(dá)模式。
[Abstract]:Actin (actin) coding gene is one of the most common internal reference genes in studying the expression pattern of plant functional genes. In this study, a pair of degenerate primers were designed according to the conserved sequence of Actin gene coding region in Chenopodiaceae. The total RNA of Atriplex canescens)4 week-old seedling leaves of halophytes was used as template. The Actin gene fragment was amplified by reverse transcription PCR(reverse transcription PCR RT PCR and ligated to the pMD19-T vector. The positive clones were sequenced after PCR detection. The sequence analysis showed that the length of the gene was 598 BP, encoding 198 amino acids, and the nucleotide sequence homology was over 84% and the amino acid sequence homology was over 94% with the Actin gene of higher plants registered in Genbank. It is a highly conserved Actin gene fragment named Acac. Sequence analysis showed that AcACT was closely related to the actin coding genes of Beta vulgaris and Suaeda glauca. Fluorescence quantitative PCR analysis showed that the expression of AcACT in salt treated tissues was constant. The results indicated that AcACT could be used as an internal reference gene to study the expression pattern of salt-tolerant genes in Chenopodium angustifolia.
【作者單位】: 蘭州大學(xué)草地農(nóng)業(yè)科技學(xué)院草地農(nóng)業(yè)生態(tài)系國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(31372360) “本科教學(xué)工程”國(guó)家級(jí)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目(201610730105) “中央高;究蒲袠I(yè)務(wù)費(fèi)專(zhuān)項(xiàng)資金”自由探索項(xiàng)目(lzujbky-2015-250)
【分類(lèi)號(hào)】:Q943.2

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本文編號(hào):1964179

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