鮑氏志賀菌臨床株的毒力基因檢測(cè)和分子分型
發(fā)布時(shí)間:2018-05-29 06:34
本文選題:志賀菌屬 + 鮑氏; 參考:《天津醫(yī)科大學(xué)》2017年碩士論文
【摘要】:目的:研究2015年夏季門(mén)診收集到的9株鮑氏志賀菌,對(duì)其菌株采用生化鑒定、藥敏鑒定、PCR擴(kuò)增毒力基因和PFGE技術(shù)了解鮑氏志賀菌臨床分離株毒力基因分布、耐藥性、分子分型及菌株間流行病學(xué)相關(guān)性。方法:1、從2015年夏季天津某綜合三甲醫(yī)院腹瀉病門(mén)診就診患者糞便中分離培養(yǎng)志賀菌,經(jīng)常規(guī)生化鑒定和血清學(xué)分型證實(shí)。2、藥物敏感性分析:采用K-B紙片擴(kuò)散法進(jìn)行抗生素藥物敏感實(shí)驗(yàn),共包含13種藥物:氨芐西林(AMP)、頭孢他啶(CTZ)、鏈霉素(STR)、慶大霉素(GM)、復(fù)方新諾明(SMZco)、頭孢噻肟(CTX)、頭孢曲松(CTR)、四環(huán)素(TE)、諾氟沙星(NOR)、左氧氟沙星(LVP)、阿米卡星(AMK)、頭孢哌酮-舒巴坦(CSL)和亞胺培南(IMP)。3、毒力基因檢測(cè):采用聚合酶鏈反應(yīng)PCR技術(shù)擴(kuò)增染色體以及質(zhì)粒上攜帶的的毒力基因:ipa H,ial,,set1A,set1B,sen,vir A,ics A,sat,pic,sep A,Sig A.4、采用多位點(diǎn)序列分型(multilocus sequence typing,MLST)技術(shù)和脈沖場(chǎng)凝膠電泳(Pulsed Field Gel Electrophoresis,PFGE)技術(shù)分析9株鮑氏志賀菌之間的親緣關(guān)系。結(jié)果:1、血清分型及生化鑒定結(jié)果9株鮑氏志賀菌分為3個(gè)亞型:Ⅰ型1株(C2),Ⅱ型3株(C10、C12、C13),Ⅳ型5株(C4、C8、C14、C15、C16)。2、藥敏試驗(yàn)結(jié)果:9株鮑氏志賀菌均為多重耐藥菌。其中,AMP的耐藥率為9/9,TE、NOR、LVP的耐藥率為6/9,CTX、CTR的耐藥率為5/9,STR、GM、SMZco的耐藥率為4/9,CTZ的耐藥率1/9,9株鮑氏志賀菌全部對(duì)AMK、CSL和IMP敏感。3、毒力基因檢測(cè)結(jié)果9株鮑氏志賀菌中,ipaH的檢出率為9/9,pic的檢出率為4/9(C8、C14、C15、C16),sep A的檢出率為5/9(C8、C12、C14、C15、C16),sat的檢出率為7/9(C4、C10、C12、C13、C14、C15、C16),sen、set1A、set1B、ial、vir A、ics A、Sig A的檢出率均為0。其中3株菌同時(shí)攜帶pic、sat、sep A,1株菌同時(shí)攜帶pic和sep A,1株菌同時(shí)攜帶sat和sep A。4、PFGE和多位點(diǎn)序列分析結(jié)果:9株鮑氏志賀菌共分為8個(gè)帶型,相似性在63.21%~96.72%。以相似度90%判斷為同一克隆群:C10和C13屬于同一型,相似率為100%,其余菌株各為一型。MLST庫(kù)分析顯示,兩株(C10和C13)屬于ST131:adk(53)、fum C(40)、gyr B(47)、icd(13)、mdh(36)、pur A(28)、rec A(29);6株(C4、C8、C12、C14、C15、C16)屬于ST648:adk(92)、fum C(4)、gyr B(87)、icd(96)、mdh(70)、pur A(58)、rec A(2);1株(C2)為ST10:adk(10)、fum C(11)、gyr B(4)、icd(8)、mdh(8)、pur A(8)、rec A(2)結(jié)論:1.本次分離的鮑氏志賀菌生化反應(yīng)結(jié)果和大腸桿菌十分相似。2.本次分離的鮑氏志賀菌均為多重耐藥菌,耐藥情況嚴(yán)重。3.本次分離的鮑氏志賀菌均可檢測(cè)到侵入性質(zhì)粒相關(guān)抗原ipa H,與其他志賀菌血清型比較結(jié)果一致。4.通過(guò)PFGE和MLST分析發(fā)現(xiàn),本次分離的鮑氏志賀菌流行病學(xué)相關(guān)性低,結(jié)合病人的就診時(shí)間、臨床癥狀,判斷感染可能屬散發(fā)。雖然其分離數(shù)量有所上升,但是我們?nèi)狈σ欢ǖ牧餍胁W(xué)資料,對(duì)于分離率上升的原因還需進(jìn)一步探究
[Abstract]:Objective: to study 9 strains of Shigella baumannii collected from outpatient clinic in summer of 2015, and to investigate the distribution and drug resistance of virulence genes of Shigella baumannii clinical isolates by biochemical identification, drug sensitivity identification, PCR amplification of virulence genes and PFGE technique. Molecular typing and epidemiological correlation among strains. Methods: 1. Shigella was isolated and cultured from feces of patients with diarrhoeal diseases in a comprehensive third class hospital in Tianjin in summer of 2015. Confirmed by routine biochemical identification and serological typing. Drug sensitivity analysis: K-B disk diffusion method was used for antibiotic susceptibility test. A total of 13 drugs were included: ampicillin, ceftazidime, streptomycin, gentamicin, SMZcoX, cefotaxime, ceftriaxone, tetracycline, norfloxacin, levofloxacin LVPN, amitoxacin AMK, cefoperazone-sulbactam, ceftriaxone, norfloxacin, levofloxacin, amicarbazone, cefoperazone-sulbactam. Detection of virulence genes: polymerase chain reaction (PCR) technique was used to amplify chromosomes and the virulence gene carried on the plasmids. The phylogenetic relationship of 9 Shigella baumannii strains was analyzed by electrophoretic Field Gel electrophoresis-PFGE technique. Results 9 strains of Shigella baumannii were classified into three subtypes: type 鈪,
本文編號(hào):1949863
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