苦瓜McAPX2基因及其啟動子的克隆與表達(dá)分析
發(fā)布時間:2018-05-26 01:56
本文選題:苦瓜 + McAPX基因。 參考:《熱帶作物學(xué)報(bào)》2016年12期
【摘要】:基于苦瓜葉片均一化文庫克隆得到McAPX2基因的cDNA全長序列(Gen Bank登錄號:KJ722767.1),采用染色體步移法獲得該基因的啟動子序列,實(shí)時熒光定量PCR技術(shù)檢測該基因在不同器官中的表達(dá)量及低溫脅迫對McAPX2表達(dá)量的影響。結(jié)果表明:McAPX2基因全長1 086 bp,開放閱讀框747 bp,編碼249個氨基酸;McAPX2屬于過氧化物酶家族ClassⅠ的成員,其脂肪族氨基酸指數(shù)為83.90,是一個親水性蛋白,可推測定位于細(xì)胞質(zhì)中;與甜瓜(NP_001284378.1)、黃瓜(ACO90193.1)、南瓜(AHF27424.1)、苦瓜(AGJ72851.1)同源性較高,分別為95%,94%,94%和93%;q RT-PCR結(jié)果顯示,在苦瓜的根、莖、葉、雌花和幼果等組織器官中McAPX2的表達(dá)量存在顯著差異,其中根的表達(dá)量最大,而在葉片中的表達(dá)量最低;在低溫脅迫下,隨著脅迫時間的延長,McAPX2表達(dá)量逐漸上調(diào),處理12 h時達(dá)到最大,隨后下降,說明該基因的表達(dá)與苦瓜耐低溫脅迫相關(guān)。分離得到McAPX2基因上游調(diào)控序列1 267 bp,其啟動子含有與GA、ABA、CTK、乙烯等激素和病原菌等生物脅迫以及熱激、干旱、低溫、光等非生物脅迫的相關(guān)元件。
[Abstract]:Based on the homogenization library of Momordica charantia L., the full-length cDNA sequence of McAPX2 gene was cloned, and the promoter sequence of the gene was obtained by chromosome step method, the accession number of GenGen Bank was: KJ722767.1. The expression of the gene in different organs and the effect of low temperature stress on the expression of McAPX2 were detected by real-time fluorescence quantitative PCR. The results showed that 1 086 BP of 1: McAPX2 gene and 747 BP of open reading frame, McAPX2 encoding 249 amino acids belong to the peroxidase family Class 鈪,
本文編號:1935495
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