植物乳桿菌LY-78乳酸脫氫酶基因的生物信息學(xué)分析
本文選題:植物乳桿菌 + 乳酸脫氫酶。 參考:《食品科學(xué)》2017年08期
【摘要】:目的:探究植物乳桿菌LY-78菌株全部5個(gè)乳酸脫氫酶基因及其編碼蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能。方法:應(yīng)用多種生物信息學(xué)軟件對(duì)植物乳桿菌LY-78菌株的5個(gè)乳酸脫氫酶基因及氨基酸序列進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析和功能預(yù)測(cè)。結(jié)果:植物乳桿菌LY-78中5個(gè)乳酸脫氫酶的核苷酸及氨基酸序列均具有較高的保守性,均為位于細(xì)胞質(zhì)的熱穩(wěn)定性、非分泌、非跨膜蛋白,除了ldh L3基因,其余4個(gè)基因均具有各自高度保守的功能位點(diǎn)和結(jié)構(gòu)域,均存在典型的煙酰胺腺嘌呤二核苷酸(nicotinamide adenine dinucleotide,NAD~+)結(jié)合位點(diǎn)序列GXGXXG。結(jié)論:乳酸脫氫酶D1(D1-lactate dehydrogenase,D1-LDH)、D2-LDH、L1-LDH及L2-LDH均具有完整的功能位點(diǎn)和結(jié)構(gòu)域,很可能具有真正的乳酸脫氫酶活性,L3-LDH由于缺失NAD~+結(jié)合結(jié)構(gòu)域和功能位點(diǎn),因而可能不具有乳酸脫氫酶活性,這些分析結(jié)果為今后植物乳桿菌乳酸脫氫酶基因改造和苯乳酸合成代謝機(jī)制研究提供了必要的理論基礎(chǔ)。
[Abstract]:Aim: to investigate the structure and function of all 5 lactate dehydrogenase genes and their encoded proteins in Lactobacillus plantarum LY-78 strain. Methods: the structure and function of 5 lactate dehydrogenase genes and amino acid sequences of Lactobacillus plantarum LY-78 strains were analyzed and predicted by bioinformatics software. Results: the nucleotides and amino acid sequences of five lactate dehydrogenase in Lactobacillus plantarum LY-78 were all highly conserved, all of them were located in the cytoplasmic thermal stability, non-secretory, non-transmembrane protein, except for ldh L3 gene. The other four genes all had their own highly conserved functional sites and domains, and all had typical nicotinamide adenine dinucleotide- NAD- binding site GXGXXG. Conclusion: L1-LDH and L2-LDH have complete functional sites and domains. It is possible that L3-LDH has no lactate dehydrogenase activity due to the absence of NAD- binding domain and functional site. These results provide a theoretical basis for the further study of Lactobacillus plantarum lactate dehydrogenase gene transformation and the metabolic mechanism of phenyllactic acid biosynthesis.
【作者單位】: 黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)食品學(xué)院;國(guó)家雜糧工程技術(shù)研究中心;
【基金】:黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)研究生創(chuàng)新科研項(xiàng)目(YJSCX2016-Y37) 黑龍江省青年科學(xué)基金項(xiàng)目(QC2014C020)
【分類號(hào)】:TS201.3
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,本文編號(hào):1924666
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