FOXE1、ATM及Pre-miR-146a基因多態(tài)性與乳頭狀甲狀腺癌的遺傳關(guān)聯(lián)性研究
本文選題:乳頭狀甲狀腺癌 + 病因 ; 參考:《吉林大學》2017年博士論文
【摘要】:甲狀腺癌是一種內(nèi)分泌系統(tǒng)常見的惡性腫瘤,是目前危害女性健康的十大癌種之一。近年來隨著甲狀腺癌的發(fā)病率越來越高,對其發(fā)病機制的研究也日益增多。研究結(jié)果表明甲狀腺癌的發(fā)生和發(fā)展是多基因共同參與的結(jié)果,但其發(fā)病機制尚不完全明確。目的:探討FOXE1、ATM及Pre-miR-146a基因多態(tài)性與乳頭狀甲狀腺癌之間的關(guān)系。方法:采用病例對照研究設(shè)計,病例組選取861例乳頭狀甲狀腺癌患者(PTC)、562例甲狀腺良性腫瘤患者(NG),對照組為896例健康人(NC)。采集各組人群的外周靜脈血5ml,提取基因組DNA。結(jié)合課題組前期發(fā)表的陽性結(jié)果和GWAS報告的部分陽性結(jié)果在FOXE1、ATM及pre-miR-146a基因選取8個陽性位點(分別為FOXE1基因的rs965513、rs944289、rs1443434位點,ATM基因的rs373759、rs664677、rs189037、rs4988099位點,pre-miR-146a的rs2910164位點)。應用基質(zhì)輔助激光解吸附電離飛行時間質(zhì)譜儀檢測各基因位點的基因型。獲取數(shù)據(jù)后利用統(tǒng)計軟件SPSS21.0、在線軟件SNPStats program和GMDR進行相關(guān)統(tǒng)計學分析。結(jié)果:1.FOXE1基因rs965513位點G、A等位基因頻數(shù)分布在PTC組與NC組間差異具有統(tǒng)計學意義(P=0.007),具有A等位基因增加了PTC的患病風險(OR=1.34,95%CI:1.08-1.67);共顯性模型為該位點的最優(yōu)遺傳模型,在此模型下該位點基因型頻數(shù)分布在PTC組與NC組間差異具有統(tǒng)計學意義(P=0.008),AA基因型相對于GG增加了患有PTC的風險(OR=3.81,95%CI:1.25-11.63);該位點與NG的關(guān)聯(lián)分析中,調(diào)整年齡后該位點G、A等位基因頻數(shù)分布在NG組與NC組間差異無統(tǒng)計學意義(P=0.93);隱性模型為該位點的最優(yōu)遺傳模型,此模型下該位點基因型頻數(shù)分布在NG組與NC組間差異具有統(tǒng)計學意義(P=0.006),AA基因型相對于GG+GA增加了患有NG的風險(OR=4.53,95%CI:1.41-14.59);FOXE1基因rs965513與PTC的性別分層分析顯示,該位點G、A等位基因頻數(shù)分布在女性PTC組差異具有統(tǒng)計學意義(P=0.041),具有A等位基因增加了女性PTC的患病風險(OR=1.30,95%CI:1.01-1.67),但G、A等位基因頻數(shù)分布在男性PTC組差異沒有統(tǒng)計學意義(P=0.070);在女性PTC組中共顯性遺傳為該位點的最優(yōu)遺傳模式,此模式下該位點基因型頻數(shù)分布差異有統(tǒng)計學意義(P=0.044)。2.FOXE1基因rs944289位點C、T等位基因頻數(shù)分布在PTC組與NC組間差異具有統(tǒng)計學意義(P=0.002),具有C等位基因增加了PTC的患病風險(OR=1.23,95%CI:1.08-1.41);共顯性模型為該位點的最優(yōu)遺傳模型,此模型下該位點基因型頻數(shù)分布在PTC組與NC組間差異具有統(tǒng)計學意義(P=0.010),TT基因型相對于CC增加了患有PTC的風險(OR=1.52,95%CI:1.15-1.99);該位點與NG的關(guān)聯(lián)分析中,調(diào)整年齡后該位點C、T等位基因頻數(shù)分布在NG組與NC組間差異具有統(tǒng)計學意義(P=0.002);隱性模型為該位點的最優(yōu)遺傳模型,此模型下該位點基因型頻數(shù)分布在NG組與NC組間差異具有統(tǒng)計學意義(P=0.001),TT基因型相對于CC+CT增加了患有NG的風險(OR=1.60,95%CI:1.22-2.10);FOXE1基因rs944289與PTC的性別分層分析顯示,該位點C、T等位基因頻數(shù)分布在女性PTC組間差異具有統(tǒng)計學意義(P=0.001),具有T等位基因增加了PTC的患病風險OR=1.29,95%CI:1.10-1.50);在女性PTC組中共顯性遺傳為該位點的最優(yōu)遺傳模式,此模式下該位點基因型頻數(shù)分布差異有統(tǒng)計學意義(P=0.005),TT基因型相對于CC或CT基因型,增加了女性患有PTC的風險(OR=1.67,95%CI:1.22-2.28)。3.FOXE1基因rs1443434位點G、T等位基因頻數(shù)分布在PTC組與NC組間差異具有統(tǒng)計學意義(P=0.003),具有T等位基因降低了PTC的患病風險(OR=0.75,95%CI:0.62-0.91);該位點基因型頻數(shù)分布在PTC組與NC組間差異具有統(tǒng)計學意義(P=0.01),TT基因型相對于GG降低了患有PTC的風險(OR=0.45,95%CI:0.24-0.87),提示該位點可能與PTC有關(guān)聯(lián);FOXE1基因rs1443434與PTC的性別分層分析顯示,該位點G、T等位基因頻數(shù)分布在男性PTC組間差異具有統(tǒng)計學意義(P=0.005),具有T等位基因降低了男性PTC的患病風險(OR=0.57,95%CI:0.38-0.84),但該位點G、T等位基因頻數(shù)分布在女性PTC組間差異具無統(tǒng)計學意義(P=0.070);在男性PTC組中共顯性遺傳為該位點的最優(yōu)遺傳模式,此模式下該位點基因型頻數(shù)分布差異有統(tǒng)計學意義(P=0.015),TT基因型相對于GG或GT基因型降低了男性患有PTC的風險(OR=0.57,95%CI:0.38-0.84)。4.ATM基因rs373759的AA基因型相對于G/G或G/A增加了患有NG的風險(OR=1.45,95%CI:1.06-1.99),而與PTC無關(guān)聯(lián);ATM基因上rs664677、rs189037和rs49880994三個位點等位基因頻率和基因型頻率分布在PTC組和NC組間、NG和NC組間差異均無統(tǒng)計學意義(P均0.05);ATM基因各位點組成的單體型中,rs664677-rs189037、rs373759-rs664677-rs189037、rs664677-rs189037-rs4988099和rs373759-rs664677-rs189037-rs4988099組成的4個單體型在PTC組和NC組中的分布差異具有統(tǒng)計學意義(P均0.05),提示這些單倍型可能與PTC有關(guān)聯(lián)。5.Pre-miR-146a基因rs2910164位點等位基因頻率和基因型頻率分布在PTC組和NC組間、NG和NC組間差異均無統(tǒng)計學意義(P均0.05)。6.各位點與甲狀腺功能相關(guān)臨床指標間的相關(guān)性分析發(fā)現(xiàn),在PTC患者組中,ATM基因rs373759位點不同基因型在其血清TSH水平差異具有統(tǒng)計學意義(P=0.042),基因型為GG的病人TSH水平高于基因型為AA的病人;在PTC患者組中pre-miR-146a基因rs2910164不同基因型在其血清TPOAb水平差異具有統(tǒng)計學意義(P=0.012),基因型為GG的病人TPOAb水平高于基因型為GC和CC患者;在NG患者組,rs2910164不同基因型患者其血清TGAb水平差異具有統(tǒng)計學意義(P=0.041);在PTC患者組中FOXE1基因rs965513和rs944289位點不同基因型患者其血清TSH水平差異具有統(tǒng)計學意義(P=0.015;P=0.003)。7.GMDR基因與基因交互作用分析結(jié)果顯示,ATM基因上rs373759和FOXE1基因上rs944289和rs965513組成rs373759/rs944289/rs965513為最佳的模型,其交叉驗證一致性最高(CVC為10/10),所建交互作用模型具有統(tǒng)計學意義(х2=14.7464,P=0.0001),說明ATM基因與FOXE1基因具有交互作用與PTC有關(guān)聯(lián)。結(jié)論:1.FOXE1基因上rs965513和rs944289位點均與PTC和NG有關(guān)聯(lián),rs1443434位點與PTC有關(guān)聯(lián),提示FOXE1基因可能與PTC和NG的發(fā)生有關(guān)聯(lián),特別是在女性PTC患者中;2.ATM基因rs373759位點可能與NG有關(guān)聯(lián);ATM基因4個位點組成的多種單倍型可能與PTC有關(guān)聯(lián),提示ATM基因在PTC的發(fā)生中可能存在微效作用;3.Pre-miR-146a基因可能與PTC和NG不存在遺傳關(guān)聯(lián);4.ATM基因rs373759位點可能與乳頭狀甲狀腺癌患者血清TSH水平有關(guān)聯(lián);Pre-miR-146a基因rs2910164位點可能與PTC血清TPOAb、TGAb水平有關(guān)聯(lián);FOXE1基因rs965513和rs944289位點可能與PTC患者血清TSH水平有關(guān)聯(lián);5.ATM基因與FOXE1基因的交互作用與PTC的患病風險有關(guān)聯(lián)。
[Abstract]:The results showed that the frequency distribution of G and A alleles in patients with thyroid cancer increased significantly ( OR = 3.81 , 95 % CI : 1.08 - 1.67 ) .
【學位授予單位】:吉林大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:R736.1
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本文編號:1906481
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