本文選題：豆科植物 + 查爾酮合成酶�。� 參考：《華北農(nóng)學(xué)報》2016年06期

【摘要】：查爾酮合成酶(Chalcone synthase,CHS)是參與合成植物苯丙烷類物質(zhì)的主要酶類之一。研究豆科植物CHS基因密碼子的偏好性,對提高豆科植物CHS基因的表達水平具有重要意義。為此,運用CHIPS、CUSP和Codon W程序分析豆科植物CHS基因密碼子的偏好性,并用決明CHS基因?qū)Ψ治鼋Y(jié)果的可信度進行驗證。結(jié)果表明,在豆科植物CHS基因的密碼子中,以A或U結(jié)尾的密碼子偏好性較強。基于CHS基因RSCU值的聚類結(jié)果顯示,豆科植物與茄科植物(包括煙草)聚為一類,表明煙草作為研究豆科植物CHS基因功能的模式植物較為合適。通過對決明CHS基因密碼子偏好性與大腸桿菌和酵母基因組密碼子偏好性的比較,發(fā)現(xiàn)兩者均存在差異,但酵母的差異低于大腸桿菌,表明酵母表達系統(tǒng)更加適合作為決明CHS基因的外源表達系統(tǒng)。然而,若要使決明CHS基因能夠在酵母表達系統(tǒng)中高效表達,仍需對其密碼子進行優(yōu)化。
[Abstract]:Chalcone synthase CHS (Chalcone synthase) is one of the main enzymes involved in the synthesis of phytopropanes. It is important to study the preference of CHS gene codon in legume plants to improve the expression level of CHS gene. Therefore, the preference of CHS codon in legume plants was analyzed by using CHIPSU CUSP and Codon W program, and the reliability of the results was verified by using the CHS gene of Cassia. The results showed that the codon at the end of A or U was stronger in the codon of CHS gene in Leguminosae. The clustering results based on the RSCU value of CHS gene showed that legume and eggplant (including tobacco) were clustered together, which indicated that tobacco was more suitable as a model for studying the function of CHS gene in legume. By comparing the codon preference of CHS gene with Escherichia coli and yeast genome codon preference, it was found that there were differences between them, but the difference between yeast and Escherichia coli was lower than that of Escherichia coli. The results showed that yeast expression system was more suitable for exogenous expression of CHS gene. However, in order to efficiently express the CHS gene in yeast, the codon should be optimized.
【作者單位】： 西南交通大學(xué)生命科學(xué)與工程學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(31371232;31500276) 成都市科技技術(shù)研發(fā)項目(2015-HM01-00051-SF) 西南交通大學(xué)校級大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計劃資助項目(151607)
【分類號】：Q943.2

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本文編號：1906174