丹參SmbHLH37基因的克
本文選題:丹參 + 堿性螺旋-環(huán)-螺旋(bHLH); 參考:《農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào)》2017年06期
【摘要】:堿性螺旋-環(huán)-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)轉(zhuǎn)錄因子家族在植物的生長(zhǎng)發(fā)育、響應(yīng)非生物脅迫等方面發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。為了進(jìn)一步豐富丹參(Salvia miltiorrhiza)中該家族成員的研究,尋找新的參與調(diào)控丹參次生代謝產(chǎn)物合成相關(guān)的bHLH成員,本研究基于丹參轉(zhuǎn)錄組和基因組數(shù)據(jù)庫(kù),分別從cDNA和gDNA水平克隆獲得SmbHLH37基因序列。該基因序列長(zhǎng)1 506 bp,包含1個(gè)27 bp的內(nèi)含子序列,1 479 bp完整的CDS(GenBank登錄號(hào):KP257470.1),編碼492個(gè)氨基酸。Blast P分析結(jié)果顯示,SmbHLH37與芝麻(Sesamum indicum)等植物的bHLH3同源性較高;SmbHLH37蛋白與擬南芥(Arabidopsis thaliana)bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族的分子進(jìn)化樹(shù)結(jié)果顯示,SmbHLH37與擬南芥bHLH轉(zhuǎn)錄因子At JAM3(A.thaliana jasmonate-associated MYC2-like3)親緣關(guān)系最近。亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示,SmbHLH37蛋白主要定位在細(xì)胞核中。qRT-PCR分析結(jié)果顯示,SmbHLH37在葉中的表達(dá)量最高,花中最低;用脫落酸(abscisic acid,ABA)和機(jī)械誘導(dǎo)處理后,該基因的表達(dá)短時(shí)間呈上調(diào)趨勢(shì);同時(shí),SmbHLH37在Sm MYC2過(guò)表達(dá)株系OE-8和OE-12中的表達(dá)量顯著上調(diào)(P0.05)。研究結(jié)果為進(jìn)一步開(kāi)展SmbHLH37功能研究提供了基礎(chǔ)資料。
[Abstract]:Basic helix-loop-helixhlhh (basic helix-loop-helixhh) transcription factor family plays an important role in plant growth and development, response to abiotic stress, and so on. In order to further enrich the family members of Salvia miltiorrhizae and find new bHLH members involved in regulating the synthesis of secondary metabolites of Salvia miltiorrhizae, this study was based on the transcriptome and genomic database of Salvia miltiorrhizae. The sequence of SmbHLH37 gene was obtained from cDNA and gDNA. The gene sequence is 1 506bpand contains a 27bp intron sequence of 1 479bp complete CDS(GenBank accession number: KP257470.1, encoding 492 amino acids .Blast P analysis results show that SmbHLH37 has high bHLH3 homology with Arabidopsis thaliana and other plants such as Sesamum indicum. The molecular phylogenetic tree of Arabidopsis thaliana)bHLH transcription factor family showed that SmbHLH37 was closely related to Arabidopsis bHLH transcription factor at JAM3(A.thaliana jasmonate-associated MYC2-like 3. The results of subcellular localization showed that the SmbHLH37 protein was mainly located in the nucleus. QRT-PCR analysis showed that the expression of SmbHLH37 was the highest in the leaves and the lowest in the flower, and the expression of SmbHLH37 was up-regulated in a short time after abscisic acidmatine (ABA) and mechanical induction. At the same time, the expression of SmbHLH37 in Sm MYC2 overexpression lines OE-8 and OE-12 was significantly up-regulated (P0.05). The results provide basic data for further research on SmbHLH37 function.
【作者單位】: 陜西師范大學(xué)西北瀕危藥材資源開(kāi)發(fā)國(guó)家工程實(shí)驗(yàn)室/藥用植物資源與天然藥物化學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.31670299)
【分類(lèi)號(hào)】:Q943.2;S567.53
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1 曹雋U,
本文編號(hào):1896872
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