葡萄實(shí)時(shí)定量PCR中穩(wěn)定內(nèi)參基因的篩選
本文選題:葡萄 + ge; 參考:《果樹學(xué)報(bào)》2016年03期
【摘要】:【目的】通過ge Norm軟件篩選實(shí)時(shí)熒光定量PCR穩(wěn)定內(nèi)參基因,基于多內(nèi)參基因評(píng)價(jià)體系進(jìn)行目的基因相對(duì)表達(dá)量的計(jì)算。【方法】獲得不同葡萄品種葉片和果皮中6個(gè)候選內(nèi)參基因的循環(huán)閾值(Ct),利用ge Norm軟件計(jì)算內(nèi)參基因平均表達(dá)穩(wěn)定性數(shù)值M和基因配對(duì)差異值V,從而判斷內(nèi)參基因最適組合。【結(jié)果】發(fā)現(xiàn)候選內(nèi)參基因表達(dá)穩(wěn)定性由高到低的排列順序?yàn)閂v EF1r=Vv EF1-αVv GAPDHVv ACTINVv ACT1Vv UBQ,不同組織分別分析均發(fā)現(xiàn)Vv EF1-α和Vv EF1r的穩(wěn)定性最高,且基因配對(duì)差異值V2/3為0.104,所以內(nèi)參基因的最適組合為Vv EF1-α和Vv EF1r。利用ge Norm軟件計(jì)算得到的多內(nèi)參基因評(píng)價(jià)體系的標(biāo)準(zhǔn)化因子可應(yīng)用于目的基因的相對(duì)表達(dá)量分析。【結(jié)論】ge Norm軟件篩選實(shí)時(shí)熒光定量PCR穩(wěn)定內(nèi)參基因的方法可以應(yīng)用到多條件和多組織的不同植物樣本中,并用于目的基因表達(dá)譜的研究,具有重要的廣泛應(yīng)用價(jià)值。
[Abstract]:[objective] to screen the stable internal reference gene of real-time fluorescent quantitative PCR by ge Norm software. The relative expression of target gene was calculated based on the multiple internal reference gene evaluation system. [methods] the cyclic threshold of 6 candidate internal reference genes in leaves and pericarp of different grape varieties was obtained, and the GE Norm software was used to calculate the internal reference gene. The average expression stability value M and gene pairing difference value V were used to judge the optimal combination of endogenous reference genes. [results] it was found that the sequence of stability of candidate internal reference genes from high to low was VV EF1r=Vv EF1- 偽 Vv GAPDHVv ACTINVv ACT1Vv UBQs, and different tissues. The stability of Vv EF1- 偽 and Vv EF1r were found to be the highest. The difference of gene pairing value V2 / 3 is 0.104, so the optimal combination of internal reference gene is VvEF1- 偽 and VvEF1r. The standardized factors calculated by ge Norm software can be used to analyze the relative expression of the target gene. [conclusion] the method of screening real-time fluorescent quantitative PCR stable endogenous reference gene by ge Norm software can be used. To apply to different plant samples with multiple conditions and multiple tissues, And used in the study of target gene expression profile, has an important and extensive application value.
【作者單位】: 上海農(nóng)業(yè)科學(xué)院林木果樹研究所;上海交通大學(xué)農(nóng)學(xué)與生物技術(shù)學(xué)院;
【基金】:國(guó)家葡萄產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系項(xiàng)目(CARS-30-9) 上海市農(nóng)委科技興農(nóng)推廣項(xiàng)目[滬農(nóng)科推字(2012)第1-2號(hào)]
【分類號(hào)】:S663.1
【二級(jí)參考文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):1895495
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