新疆野扁桃AlsCBF1-A基因的克隆及生物信息學分析
發(fā)布時間:2018-05-15 20:46
本文選題:野扁桃 + 轉錄因子; 參考:《分子植物育種》2017年01期
【摘要】:以野扁桃為實驗材料,提取葉片的RNA,設計基因特異性引物,利用RT-PCR克隆轉錄因子CBF的c DNA全長,命名為Als CBF1-A(登錄號KU975456);并對其基因和蛋白進行了生物信息學分析。結果表明,該轉錄因子基因的CDS區(qū)長699 bp,編碼232個氨基酸,編碼蛋白相對分子質(zhì)量約為26.027 2 k D,p I 4.84;由無規(guī)則卷曲(C),α-螺旋(H),β-折疊(E)組成,分別占52.17%,21.74%和26.09%;有較強的親水性,無跨膜區(qū)和信號肽存在,有8處絲氨酸磷酸化位點、2處蘇氨酸磷酸化位點、2處酪氨酸磷酸化位點;同源性分析表明Als CBF1-A基因在高等植物中保守性較高。本研究顯示CBF轉錄因子可能與野扁桃的抗寒性相關,此研究為野扁桃抗寒分子機理的進一步研究提供了幫助。
[Abstract]:The gene and protein of wild almond were analyzed . The results showed that the length of the transcription factor gene was 699 bp , and it was named Als CBF1 - A ( accession number KU975456 ) . The results showed that the length of the transcription factor gene was 699 bp , and the relative molecular weight of the coding protein was 26 . 17 % , 21.74 % and 26.09 % , respectively .
【作者單位】: 新疆農(nóng)業(yè)大學農(nóng)學院;新疆農(nóng)業(yè)科學院園藝作物研究所;新疆農(nóng)業(yè)大學林學與園藝學院;
【基金】:國家自然科學基金項目(31260186) 國家大學生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓練計劃項目(201400758001) 新疆維吾爾自治區(qū)“十二五”科技重大專項(201130102-1) 新疆維吾爾自治區(qū)果樹學重點學科基金(201107)共同資助
【分類號】:S662.9;Q943.2
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本文編號:1893884
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