本文選題：芽孢桿菌 + S��； 參考：《基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)》2017年11期

【摘要】：為了研究10種芽孢桿菌的基本特性,下載到70條芽孢桿菌屬細(xì)菌的16S r RNA序列,通過對比芽孢桿菌的基本特征和16S r RNA序列種內(nèi)和種間相似性,發(fā)現(xiàn)基本特征很難區(qū)分這10種菌株。16S r RNA序列種內(nèi)相似性最高為100%,最低的是B.amyloliquefaciens,種內(nèi)分化較明顯,最低值為90.85%,種間相似性最高的2個菌株是B.subtilis strain 168和B.amyloliquefaciens strain BCRC 11601,最高值為99.66%,最低為92.01%。B.subtilis、B.amyloliquefaciens、B.anthracis、B.cereus、B.methylotrophicus、B.atrophaeus之間某些菌株的16S r RNA相似性極高,通過16S r RNA序列很難區(qū)分,B.coagulans的16S r RNA特異性最好。同時(shí)本研究提供了gyr A、gyr B、rpo A、yya R、yya O等多個能夠準(zhǔn)確鑒定的特異性基因,為快速鑒定菌種提供了便利。
[Abstract]:In order to study the basic characteristics of 10 kinds of Bacillus, the 16s r RNA sequences of 70 strains of Bacillus were downloaded. The basic characteristics of Bacillus and the similarity between species and species of 16s r RNA sequences were compared. It was found that it was difficult to distinguish the basic characteristics of the 10 strains. The similarity of the 10 strains was 100%, and the lowest was B. amylolique faciens. The lowest value was 90.85, the two strains with the highest similarity among species were B.subtilis strain 168 and B.amyloliquefaciens strain BCRC 11601, the highest value was 99.66, and the lowest value was 92.01. B. subtilisa B.amyloliquefaciens B.cereusus B. methylotrophicus B.atrophaeus had the highest similarity of 16s r RNA. It was difficult to distinguish the specificity of 16s r RNA between B. coagulans by 16s r RNA sequence. At the same time, this study provided several specific genes, such as gyr Aurgyr Bnrpo Amoyya Rnyya O and so on, which could be accurately identified, and thus provided convenience for rapid identification of bacteria species.
【作者單位】： 海南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所海南省植物病蟲害防控重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：海南省重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃(ZDYF2016060) 省屬科研院所技術(shù)開發(fā)研究專項(xiàng)(KYYS-2015-05)共同資助
【分類號】：Q933

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本文編號：1881033