本文選題：喉鱗狀細(xì)胞癌 + TP　； 參考：《局解手術(shù)學(xué)雜志》2016年12期

【摘要】：目的挖掘隱藏在頭頸部鱗癌中抑癌基因TP53表達(dá)異常的機(jī)制。方法從TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中選取279例頭頸部鱗癌樣本的測(cè)序數(shù)據(jù),利用cbioportal獲得TP53基因在頭頸部鱗癌中的表達(dá)情況及其對(duì)患者生存的影響,并篩選樣本中與TP53存在共表達(dá)關(guān)系的基因。利用String和DAVID數(shù)據(jù)庫(kù),建立TP53的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)并分析網(wǎng)絡(luò)功能,通過(guò)lncRNA2target和Star Base數(shù)據(jù)庫(kù),篩選出能夠調(diào)控TP53的短鏈非編碼RNA(microRNA),長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)和競(jìng)爭(zhēng)性?xún)?nèi)源性RNA(ceRNA),利用Cytoscape軟件建立TP53相關(guān)基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。結(jié)果 279例頭頸部鱗癌樣本中共有77%的樣本出現(xiàn)TP53表達(dá)異常,且TP53表達(dá)異�；颊叩纳媛曙@著低于TP53正常表達(dá)的患者。此外,篩選出TP53基因的共表達(dá)基因288個(gè),(Spearman分?jǐn)?shù)和Pearson分?jǐn)?shù)0.3)功能分析結(jié)果顯示共表達(dá)基因的功能主要為轉(zhuǎn)錄調(diào)控、細(xì)胞凋亡、增殖過(guò)程和免疫應(yīng)答等功能。TP53基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)揭示has-miR-186-5p和has-miR-202-3p等43個(gè)microRNA能夠靶向調(diào)控TP53基因;此外,MEG1、TUG1和MALAT1等6個(gè)lncRNA,PHC2、FZD4和TUB等56個(gè)mRNA能夠通過(guò)ceRNA作用調(diào)控TP53。結(jié)論通過(guò)生物信息學(xué)方法和基因數(shù)據(jù)庫(kù)建立的TP53相關(guān)基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)揭示可能調(diào)控抑癌基因TP53的若干microRNA、lncRNA和ceRNA,可以為頭頸部鱗癌中TP53的作用機(jī)制和以TP53為靶點(diǎn)的分子治療提供新的切入點(diǎn)。
[Abstract]:Objective to explore the mechanism of abnormal expression of tumor suppressor gene (TP53) in head and neck squamous cell carcinoma (SCC). Methods the sequence data of 279 cases of head and neck squamous cell carcinoma were selected from TCGA database. The expression of TP53 gene in head and neck squamous cell carcinoma and its influence on the survival of patients were obtained by cbioportal, and the coexpression of TP53 gene in the sample was screened. Using String and DAVID database, the coexpression network of TP53 is established and the function of network is analyzed. Through the database of lncRNA2target and Star Base, Short chain noncoding RNAs, long chain noncoding RNAs and competitive endogenous RNAs were selected to regulate TP53. Cytoscape software was used to establish TP53 related gene regulatory networks. Results 77% of the 279 cases of head and neck squamous cell carcinoma had abnormal TP53 expression, and the survival rate of the patients with abnormal TP53 expression was significantly lower than that of the patients with normal TP53 expression. In addition, the functional analysis of 288 coexpression genes of TP53 gene showed that the function of co-expressed genes was mainly transcriptional regulation and apoptosis. Proliferation and immune response. TP53 gene regulatory network revealed that 43 microRNA such as has-miR-186-5p and has-miR-202-3p could target TP53 gene, and 56 mRNA, such as PHC2FZD4 and TUB, could regulate TP53 through ceRNA. Conclusion the TP53 related gene regulatory network established by bioinformatics and gene database reveals some microRNAs lncRNA and ceRNAs that may regulate tumor suppressor gene TP53, which may be the mechanism of TP53 in head and neck squamous cell carcinoma and the target molecule of TP53. Treatment provides new entry points.
【作者單位】： 內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院耳鼻咽喉科;
【基金】：內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)科技百萬(wàn)工程項(xiàng)目(KJbw2013014)
【分類(lèi)號(hào)】：R739.91

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 李曉輝;異舒泛藍(lán)淋巴顯像在16例頭頸部鱗癌中的應(yīng)用[J];福建醫(yī)藥雜志;2003年06期

2 倪松;徐震綱;;進(jìn)展期頭頸部鱗癌非手術(shù)治療的研究進(jìn)展[J];實(shí)用癌癥雜志;2006年05期

3 儲(chǔ)大同;;晚期和區(qū)域性局部晚期頭頸部鱗癌的內(nèi)科治療進(jìn)展[J];醫(yī)學(xué)研究雜志;2010年02期

4 A.D.King;D.K.W.Yeung;K.S.Bhatia;龍淼淼;;頭頸部鱗癌:擴(kuò)散加權(quán)成像對(duì)于治療的預(yù)測(cè)和監(jiān)控研究[J];國(guó)際醫(yī)學(xué)放射學(xué)雜志;2010年06期

5 鄭家偉,賈學(xué)林;頭頸部鱗癌治療進(jìn)展[J];國(guó)外醫(yī)學(xué).口腔醫(yī)學(xué)分冊(cè);1995年04期

6 于俊秀;尹海林;;老年人頭頸部鱗癌[J];國(guó)外醫(yī)學(xué)(老年醫(yī)學(xué)分冊(cè));1996年03期

7 ;遺傳因素在頭頸部鱗癌起因方面的作用[J];國(guó)外醫(yī)學(xué).耳鼻咽喉科學(xué)分冊(cè);1997年04期

8 ;美國(guó)科學(xué)家的基因組測(cè)序分析揭示更多頭頸部鱗癌相關(guān)基因[J];生物學(xué)教學(xué);2012年03期

9 陶澤璋,public．wh．hb．cn,劉劍鋒,肖伯奎,楊強(qiáng),詹漢章;頭頸部鱗癌及癌旁組織端粒酶活性研究[J];癌癥;2000年07期

10 劉劍鋒,陶澤璋,楊強(qiáng),肖伯奎,詹漢章;頭頸部鱗癌及癌旁組織端粒酶活性檢測(cè)[J];臨床耳鼻咽喉科雜志;2000年06期

相關(guān)會(huì)議論文 前10條

1 何小慧;;頭頸部鱗癌的內(nèi)科治療進(jìn)展[A];第三屆中國(guó)腫瘤內(nèi)科大會(huì)教育集暨論文集[C];2009年

2 朱國(guó)培;;頭頸部鱗癌的綜合治療進(jìn)展[A];2007第六屆全國(guó)放射腫瘤學(xué)學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2007年

3 張軍;;專(zhuān)題十六:頭頸部鱗癌分子靶向放免治療:現(xiàn)狀與未來(lái)[A];首屆浙江省青年核醫(yī)學(xué)與分子影像論壇暨浙江省第十三屆核醫(yī)學(xué)與放射醫(yī)學(xué)防護(hù)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2013年

4 應(yīng)學(xué)明;陳俊;湯聲波;;同步化放療聯(lián)合尼妥珠單抗治療局部晚期頭頸部鱗癌Ⅱ期臨床研究[A];江西省中醫(yī)、中西醫(yī)結(jié)合腫瘤學(xué)術(shù)交流會(huì)論文集[C];2012年

5 倪曉光;王貴齊;;窄帶成像技術(shù)在頭頸部鱗癌早期診斷中的應(yīng)用[A];2010全國(guó)耳鼻咽喉頭頸外科中青年學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2010年

6 易俊林;高黎;黃曉東;羅京偉;李素艷;肖建平;張濤;徐國(guó)鎮(zhèn);;術(shù)前同步放化療在局部晚期頭頸部鱗癌治療中的Ⅲ期臨床研究[A];2007第六屆全國(guó)放射腫瘤學(xué)學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2007年

7 李小囡;;西妥昔單抗聯(lián)合化療治療頭頸部鱗癌初步研究[A];第八次全國(guó)口腔頜面—頭頸腫瘤會(huì)議論文匯編[C];2009年

8 許婷婷;胡超蘇;應(yīng)紅梅;朱國(guó)培;吳永如;王孝深;孔琳;沈春英;;聯(lián)合西妥昔單抗綜合治療復(fù)發(fā)/轉(zhuǎn)移性頭頸部鱗癌[A];第六屆全國(guó)鼻咽癌學(xué)術(shù)大會(huì)論文匯編[C];2010年

9 王大章;張萍;李楊;鄭光勇;胡靜;;頭頸部鱗癌的多藥耐藥性——機(jī)理與對(duì)策[A];第一屆全國(guó)口腔頜面部腫瘤學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2001年

10 徐本義;王龍龍;;TNPP方案在頭頸部鱗癌術(shù)前化療34例分析[A];第四屆中國(guó)腫瘤學(xué)術(shù)大會(huì)暨第五屆海峽兩岸腫瘤學(xué)術(shù)會(huì)議論文集[C];2006年

相關(guān)重要報(bào)紙文章 前2條

1 湖南省腫瘤醫(yī)院頭頸科 陳杰;頭頸部鱗癌患者要定期復(fù)查[N];大眾衛(wèi)生報(bào);2002年

2 朋復(fù);單一紫杉醇治療頭頸部鱗癌療效一般[N];中國(guó)高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)導(dǎo)報(bào);2001年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條

1 崔志濱;頭頸部鱗狀細(xì)胞癌中TRIM24和PLU-1基因的功能研究[D];上海交通大學(xué);2014年

2 徐偉;頭頸部鱗癌化療耐藥性與耐藥基因表達(dá)譜的相關(guān)性研究[D];中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué);2002年

3 徐金科;膠原受體DDR2在頭頸部鱗癌中的作用研究[D];第四軍醫(yī)大學(xué);2013年

4 卞卡;MicroRNA-203在頭頸部鱗癌細(xì)胞中的生物學(xué)功能及作用機(jī)制的研究[D];第四軍醫(yī)大學(xué);2014年

5 謝磊;頭頸部鱗癌對(duì)自然殺傷細(xì)胞Toll樣受體3表達(dá)的影響[D];浙江大學(xué);2007年

6 朱文淵;神經(jīng)酰胺在頭頸部鱗狀細(xì)胞癌中作用和機(jī)制的研究[D];浙江大學(xué);2014年

7 張彬;頸分區(qū)性清掃術(shù)治療頭頸部鱗癌的遠(yuǎn)期療效分析[D];中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué);2002年

8 阮宏瑩;Dehydroxymethylepoxyquinimicin（DHMEQ）/核因子kappa B抑制劑對(duì)頭頸部鱗癌細(xì)胞增殖抑制作用的研究[D];天津醫(yī)科大學(xué);2004年

9 左建宏;Bcl-2高表達(dá)誘導(dǎo)頭頸部鱗癌細(xì)胞部分EMT、促進(jìn)其侵襲和轉(zhuǎn)移機(jī)制研究[D];中南大學(xué);2012年

10 杜曉東;頭頸部鱗癌NO、iNOS的表達(dá)及保留喉功能的非開(kāi)胸頸段食管癌切除術(shù)[D];山東大學(xué);2005年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 林煒;自噬相關(guān)基因Beclin-1、葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白-1、缺氧誘導(dǎo)因子-1α在喉癌中表達(dá)及意義[D];浙江大學(xué);2015年

2 張卓;頭頸部鱗癌中Parafibromin表達(dá)及其臨床病理意義[D];遼寧醫(yī)學(xué)院;2015年

3 蔣艷明;頭頸部鱗癌指南及下頜骨放射性骨壞死的循證研究[D];廣西醫(yī)科大學(xué);2013年

4 趙明;成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子受體-3在頭頸部鱗癌中的表達(dá)及其意義[D];浙江大學(xué);2003年

5 張昊;頭頸部鱗癌術(shù)后同步放化療的臨床療效觀察[D];山東大學(xué);2009年

6 錢(qián)薇;局部晚期頭頸部鱗癌經(jīng)綜合治療取得的療效、預(yù)后相關(guān)因素和遠(yuǎn)期器官功能的研究[D];復(fù)旦大學(xué);2013年

7 周霞東;分子靶向治療在頭頸部鱗癌的臨床應(yīng)用進(jìn)展[D];蘭州大學(xué);2010年

8 李立;西妥昔單抗聯(lián)合放療治療頭頸部鱗癌臨床觀察[D];中南大學(xué);2010年

9 徐蓓;INF-γ增加頭頸部鱗癌細(xì)胞化療敏感性的機(jī)制研究[D];南京醫(yī)科大學(xué);2014年

10 唐源;放療聯(lián)合EGFR單抗治療局部晚期頭頸部鱗癌的療效分析[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2013年

，

本文編號(hào)：1871912