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單細(xì)胞水平原鈣黏蛋白基因簇的轉(zhuǎn)錄分析

發(fā)布時(shí)間:2018-05-10 13:00

  本文選題:原鈣黏蛋白基因簇 + 表達(dá)模式 ; 參考:《江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué)》2017年02期


【摘要】:原鈣黏蛋白(protocadherin,Pcdh)基因簇由緊密相連的3個(gè)基因簇(Pcdhα、Pcdhβ和Pcdhγ)組成,其中α、β基因簇包含可變區(qū)外顯子(C型和非C型)和恒定區(qū)外顯子。這種獨(dú)特的基因排列方式使Pcdh基因簇具有產(chǎn)生單細(xì)胞分子多樣性的潛能。目前,在單細(xì)胞水平有關(guān)Pcdh基因簇轉(zhuǎn)錄表達(dá)的研究較少。為了探索單細(xì)胞Pcdh基因簇的轉(zhuǎn)錄表達(dá)模式,利用顯微操作系統(tǒng)并結(jié)合RT-PCR方法,在單細(xì)胞水平分析了小鼠大腦皮層和人類神經(jīng)母細(xì)胞瘤細(xì)胞系SK-N-SH的Pcdhα和Pcdhβ基因簇表達(dá)模式。研究發(fā)現(xiàn)Pcdhα和Pcdhγ的C型和非C型亞型均是隨機(jī)表達(dá),每個(gè)單細(xì)胞表達(dá)不同組合的若干個(gè)Pcdh基因簇亞型。本研究表明,在小鼠大腦皮層及人類神經(jīng)母細(xì)胞瘤的單個(gè)細(xì)胞中,Pcdh基因簇的轉(zhuǎn)錄表達(dá)都能夠產(chǎn)生單細(xì)胞表面分子多樣性。這為進(jìn)一步揭示神經(jīng)元中Pcdh基因簇表達(dá)調(diào)控的分子機(jī)理及其在大腦神經(jīng)回路中的功能奠定理論基礎(chǔ)。
[Abstract]:The protocadherin (Pcdh) gene cluster consists of three closely linked gene clusters, Pcdh 偽, Pcdh 尾 and Pcdh 緯, in which 偽, 尾 gene clusters contain C type and non C type variable region exons) and constant region exons. This unique gene arrangement makes the Pcdh gene cluster have the potential to produce single cell molecular diversity. At present, there are few studies on transcriptional expression of Pcdh gene cluster at single cell level. In order to explore the transcriptional expression pattern of single cell Pcdh gene cluster, the expression patterns of Pcdh 偽 and Pcdh 尾 gene clusters in mouse cerebral cortex and human neuroblastoma cell line SK-N-SH were analyzed at single cell level using microoperating system and RT-PCR method. It was found that the C and non C subtypes of Pcdh 偽 and Pcdh 緯 were randomly expressed, and each single cell expressed several Pcdh gene cluster subtypes with different combinations. This study showed that the transcriptional expression of Pcdh gene cluster in mouse cerebral cortex and single cell of human neuroblastoma can produce single cell surface molecular diversity. This provides a theoretical basis for further understanding the molecular mechanism of the expression and regulation of Pcdh gene clusters in neurons and its function in the neural circuits of the brain.
【作者單位】: 上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院;上海交通大學(xué)系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院比較生物醫(yī)學(xué)中心/系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(編號(hào):91519302,812111583) 中國(guó)博士后科學(xué)基金(編號(hào):2015M571558) 上海市科學(xué)技術(shù)委員會(huì)科研計(jì)劃(編號(hào):14JC1403601)
【分類號(hào)】:Q78

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本文編號(hào):1869402


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