大豆GmMP基因的功能預(yù)測(cè)及表達(dá)分析
本文選題:大豆 + GmMP基因。 參考:《大豆科學(xué)》2017年01期
【摘要】:通過在大豆基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中檢索擬南芥AtMP(ARF5)在大豆中的同源基因,獲得了GmMP基因序列。對(duì)GmMP基因編碼的氨基酸序列及啟動(dòng)子序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析,結(jié)果表明:GmMP基因CDS序列全長(zhǎng)2 802 bp,編碼933個(gè)氨基酸。GmMP編碼的蛋白為疏水性蛋白。結(jié)構(gòu)域分析表明:GmMP含有B3和AUXIN RESPONSE FACTOR結(jié)構(gòu)域,同時(shí)該基因是ARF家族的成員。GmMP預(yù)測(cè)的啟動(dòng)子區(qū)域含有與激素、脅迫、光應(yīng)答、生物鐘調(diào)控和轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合相關(guān)的順式作用元件。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明MP在豆科植物進(jìn)化過程中比較保守。組織特異性表達(dá)分析結(jié)果顯示GmMP在葉片中表達(dá)量最低,在莖尖中表達(dá)量最高,推測(cè)其可能參與生長(zhǎng)素的代謝途徑。
[Abstract]:GmMP gene encoding amino acid sequence and promoter sequence were analyzed by bioinformatics analysis . The results showed that GmMP gene had a full length of 2 802 bp and coded 933 amino acids . GmMP coded protein was hydrophobic protein . The results showed that GmMP contained B3 and Arabidopsis IN RESPONSE FACTOR domains , and the gene was a member of ARF family .
【作者單位】: 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)大豆生物學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/農(nóng)業(yè)部東北大豆生物學(xué)與遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:抗逆轉(zhuǎn)基因大豆新品種培育專項(xiàng)(2016ZX08004-002)
【分類號(hào)】:S565.1
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