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桑樹MaGte4基因的克

發(fā)布時(shí)間:2018-05-06 08:38

  本文選題:桑樹 + MaGte ; 參考:《分子植物育種》2017年01期


【摘要】:Virp1基因是第一個(gè)被報(bào)道可以結(jié)合RNA的Bromodomain(BRD)蛋白,在馬鈴薯紡錘塊莖類病毒(potato spindle tuber viroid,PSTVd)對(duì)宿主的感染及其復(fù)制中起重要作用。本研究根據(jù)NCBI登錄的virp1基因序列和桑樹基因組數(shù)據(jù)庫設(shè)計(jì)引物,進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增和克隆測(cè)序,獲得桑樹的同源MaGte4基因長1 771 bp的序列。生物信息學(xué)分析表明,基因有3個(gè)外顯子,CDS長1 683 bp,編碼560個(gè)氨基酸,有與乙;M蛋白賴氨酸具有特異相互作用的BRD及其extra-terminal(BET)結(jié)構(gòu)域,且該結(jié)構(gòu)及其氨基酸組成在各物種間比較保守,桑樹MaGte4具有和virp1蛋白非常相似的C-末端區(qū)域,RT-PCR分析基因在正常和花葉型萎縮病桑樹葉片、葉柄和葉脈中均有表達(dá),推測(cè)MaGte4的功能可能和Virp1相類似。
[Abstract]:Virp1 gene is the first reported protein that can bind to RNA. It plays an important role in host infection and replication of potato spindle tuber viroid virus. In this study, primers were designed based on the virp1 gene sequence registered by NCBI and the mulberry genome database. The homologous MaGte4 gene of mulberry was amplified by RT-PCR and cloned and sequenced. The homologous MaGte4 gene of mulberry was 1 771bp in length. Bioinformatics analysis showed that three exons of the gene had a length of 1 683 BP, encoding 560 amino acids, and the BRD and its extra-terminalBETs had a specific interaction with acetylated histone lysine. Moreover, the structure and amino acid composition of mulberry were conserved among species. RT-PCR analysis of the C-terminal region of mulberry MaGte4, which is very similar to virp1 protein, was expressed in the leaves, petioles and veins of mulberry with normal and mosaic atrophy. It is speculated that the function of MaGte4 may be similar to that of Virp1.
【作者單位】: 安康學(xué)院陜西省蠶桑重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:陜西省青年科技新星項(xiàng)目(No.2013KJXX-96) 陜西省教育廳重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室科研計(jì)劃項(xiàng)目(No.13JS003)共同資助
【分類號(hào)】:S888.2;Q943.2

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 盧全有;夏志松;;;ㄈ~型萎縮病病原研究初報(bào)[J];蠶業(yè)科學(xué);2006年02期

【共引文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前4條

1 劉永光;田國忠;王潔;李向東;竺曉平;束懷瑞;;山東蠶區(qū)桑黃化型萎縮病病原物的分子鑒定[J];蠶業(yè)科學(xué);2009年03期

2 費(fèi)建明;白錫川;楊海江;蒯元璋;;桑花葉型萎縮病的化學(xué)防治藥劑比較試驗(yàn)[J];中國蠶業(yè);2009年02期

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 夏志松,難波成任;桑黃化型萎縮病病原體16SrRNA基因的序列分析[J];蠶業(yè)科學(xué);2004年02期



本文編號(hào):1851578

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