基因芯片技術分析轉(zhuǎn)SlNAC10基因擬南芥非生物脅迫相關差異表達基因
本文選題:SlNAC + 基因芯片; 參考:《中國細胞生物學學報》2016年08期
【摘要】:NAC(NAM、ATAF1/2和CUC2)轉(zhuǎn)錄因子是植物特有的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子,在植物的器官建成、生長發(fā)育以及抵御非生物脅迫等方面發(fā)揮著至關重要的作用。該文利用基因芯片技術篩選轉(zhuǎn)Sl NAC10基因擬南芥和野生型擬南芥非生物脅迫抗性相關差異表達基因,并通過實時熒光定量PCR對部分差異表達基因進行驗證。芯片結(jié)果顯示,差異表達2倍以上的基因有4 054個,其中與非生物脅迫相關基因有15個,與非生物脅迫相關的轉(zhuǎn)錄因子基因有14個,這些基因參與應答滲透脅迫、響應高鹽、冷、熱、高光強等脅迫。對差異表達2倍以上的基因進行GO(Gene Ontology)分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)分析,發(fā)現(xiàn)這些基因在非生物脅迫相關的13個注釋中富集,涉及相關代謝途徑96個,其中包括植物激素信號轉(zhuǎn)導、精氨酸和脯氨酸代謝、吲哚生物堿合成、谷胱甘肽代謝等。以上結(jié)果表明,SlNAC10可直接或間接調(diào)控多種下游基因的表達,提高植物抵御非生物脅迫的能力。
[Abstract]:NAC NAMN ATAF 1 / 2 and CUC 2) transcription factors are plant specific transcription regulators, which play an important role in organ building, growth and development of plants and resistance to abiotic stress. The differentially expressed genes related to abiotic stress resistance of transgenic Arabidopsis thaliana and wild type Arabidopsis thaliana were screened by gene chip technique, and some differentially expressed genes were verified by real-time fluorescence quantitative PCR. The microarray results showed that there were 4 054 differentially expressed genes, including 15 genes related to abiotic stress and 14 transcription factor genes related to abiotic stress. These genes were involved in the response to osmotic stress and responded to high salt. Cold, hot, high intensity and other stresses. GO(Gene Ontology) and KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) analysis showed that these genes were enriched in 13 notes related to abiotic stress and involved 96 related metabolic pathways, including plant hormone signal transduction. Arginine and proline metabolism, indole alkaloid synthesis, glutathione metabolism, etc. These results suggest that SlNAC10 can directly or indirectly regulate the expression of many downstream genes and improve the ability of plants to resist abiotic stress.
【作者單位】: 遼寧師范大學生命科學學院遼寧省植物生物技術重點實驗室;
【基金】:國家自然科學基金(批準號:31340052)資助的課題~~
【分類號】:Q943.2
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,本文編號:1851217
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