本文選題：沙柳 + LAS��； 參考：《分子植物育種》2017年02期

【摘要】：LAS基因?qū)τ谥参飩?cè)生分生組織有重要影響。它被證實(shí)在擬南芥、番茄等草本科植物營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)階段參與腋生分生組織的形成,但在木本植物中的基因功能尚缺乏深入研究。本研究以沙柳為材料,利用RT-PCR技術(shù)成功克隆沙柳LAS基因,命名為SpsLAS,并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明,該基因CDS序列全長(zhǎng)1 320 bp,編碼439個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)蛋白分子量為49.876 8 k D,理論等電點(diǎn)(PI)為6.66,是親水性蛋白;同源氨基酸序列比對(duì)結(jié)果表明沙柳LAS基因與番茄LS、擬南芥LAS等功能已確認(rèn)的LS亞家族基因同源性較高,氨基酸相似性達(dá)50%以上;系統(tǒng)進(jìn)化分析表明SpsLAS與杞柳和毛果楊親緣關(guān)系更近;對(duì)LAS進(jìn)行功能結(jié)構(gòu)域分析得知LAS基因具有GRAS基因家族典型特征,屬于GRAS基因家族LS亞家族;預(yù)測(cè)未發(fā)現(xiàn)跨膜結(jié)構(gòu)和信號(hào)肽區(qū)域;SpsLAS蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)包含173個(gè)α螺旋(Alpha helix),72個(gè)延伸鏈(Extended strand),194個(gè)無(wú)規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu)(Random coil);亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)該基因很可能定位于細(xì)胞核內(nèi)。沙柳LAS基因的克隆對(duì)于研究木本植物萌蘗及其分枝機(jī)制有重要意義,同時(shí)豐富了木本植物中GRAS基因家族的相關(guān)研究。
[Abstract]:LAS gene plays an important role in the lateral meristem of plants. It has been proved that it is involved in the formation of axillary meristem in the vegetative growth stage of Arabidopsis, Tomato and other grass plants, but the gene function in woody plants has not been further studied. In this study, LAS gene was cloned by RT-PCR and named as SpsLAS. and its bioinformatics analysis was carried out. The results showed that the CDS sequence was 1 320 BP, encoding 439 amino acids. The predicted molecular weight of the predicted protein was 49.876 kD, and the theoretical isoelectric point (Pi) was 6.66. It was a hydrophilic protein. The results of homologous amino acid sequence alignment showed that there was a high homology of the LS subfamily genes of Salix LAS and tomato LSand Arabidopsis LAS and the amino acid similarity was more than 50%. Phylogenetic analysis showed that SpsLAS was more closely related to willow and poplar, and the functional domain analysis of LAS showed that LAS gene had typical characteristics of GRAS gene family and belonged to LS subfamily of GRAS gene family. The transmembrane structure and signal peptide region of SpsLAS protein were not found to contain 173 alpha helixs, 72 extended strands and 194 random coils, and the subcellular localization predicted that the gene might be located in the nucleus. The cloning of LAS gene from Salix wilfordii is of great significance for studying the mechanism of flowering and branching of woody plants and enriches the study of GRAS gene family in woody plants.
【作者單位】： 內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)林學(xué)院;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31360187) 林木遺傳育種國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室(中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院)開(kāi)放課題基金(TGB2015001)共同資助
【分類號(hào)】：S793.9;Q943.2

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本文編號(hào)：1842319