青藏高原5種害鼠vkorc1基因的測(cè)序分析
本文選題：抗凝血?dú)⑹髣┛顾幮?/strong> + vkorc��； 參考：《草業(yè)科學(xué)》2016年06期
【摘要】：維生素K環(huán)氧化物還原酶復(fù)合物1基因(vkorc1)的變異是導(dǎo)致鼠類(lèi)對(duì)抗凝血?dú)⑹髣┊a(chǎn)生抗性的主要原因。本研究利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的方法,分析青藏高原地區(qū)5種主要害鼠——高原鼢鼠(Eospalax baileyi)、高原鼠兔(Ochotona curzoniae)、長(zhǎng)尾倉(cāng)鼠(Cricetulus longicaudatus)、青海田鼠(Lasiopodomys fuscus)和喜馬拉雅旱獺(Marmota himalayana)的vkorc1基因序列信息。同時(shí),采集5個(gè)種群共54只高原鼢鼠,對(duì)vkorc1基因全序列進(jìn)行測(cè)序分析。結(jié)果顯示,從轉(zhuǎn)錄組組裝結(jié)果中成功獲得5種動(dòng)物的vkorc1基因編碼區(qū)全序列,其中青海田鼠、長(zhǎng)尾倉(cāng)鼠、高原鼢鼠vkorc1基因編碼區(qū)長(zhǎng)度為486bp,喜馬拉雅旱獺和高原鼠兔為492bp;在DNA序列水平上,5種高原動(dòng)物存在143個(gè)變異位點(diǎn),與大鼠的序列相似性為80.1%~90.7%,而與小鼠的序列相似性為79.7%~89.8%。在氨基酸序列水平上,5種高原動(dòng)物存在37個(gè)變異位點(diǎn),大鼠的序列相似性為84.0%~92.0%,而與小鼠的序列相似性為85.9%~92.0%;未發(fā)現(xiàn)與已知抗凝血?dú)⑹髣┛剐韵嚓P(guān)的氨基酸位點(diǎn)。對(duì)5個(gè)種群54只高原鼢鼠vkorc1基因全序列的測(cè)序分析顯示,比對(duì)后的全長(zhǎng)為1 808bp,共檢測(cè)到8個(gè)變異位點(diǎn),其中兩個(gè)為插入缺失位點(diǎn),全部變異都發(fā)生在內(nèi)含子區(qū)。本研究首次以基因序列為分析對(duì)象,可以為青藏高原地區(qū)的鼠害防治提供關(guān)鍵基礎(chǔ)資料。
[Abstract]:The variation of vitamin K epoxide reductase complex 1 gene (vkorc1) is the main cause of resistance to anticoagulant rodenticide in mice.Using transcriptome sequencing method, the vkorc1 gene sequences of five major rodent species, Eospalax Baileyii, Ochotona curzoniae, Cricetulus longicaudatusus, Lasiopodomys fuscusae and Marmohimta alayana, were analyzed in Qinghai-Tibet Plateau.At the same time, 54 plateau zokors were collected from 5 populations and sequenced the vkorc1 gene.The results showed that the complete sequence of vkorc1 gene coding region of 5 species of animals was successfully obtained from the results of transcriptome assembly, including Qinghai vole, long-tailed hamster.The length of vkorc1 gene coding region of plateau zokor was 486 BP, and that of Himalayan marmot and plateau pika was 492 BP. There were 143 mutation sites in 5 species of plateau animals at the DNA sequence level, the similarity with the sequence of rats was 80.1 BP and that with mice was 79.7% and 89.8 respectively.At the amino acid sequence level, there were 37 mutation sites in 5 species of plateau animals, the sequence similarity of rats was 84.0 and that of mice was 85.90.There was no amino acid locus associated with known resistance to anticoagulant rodenticide.The whole vkorc1 gene sequence of 54 plateau zokors from 5 populations was analyzed. The total length of the vkorc1 gene was 1 808bp. eight mutation sites were detected, two of which were insertion deletion sites, all of which occurred in intron region.In this study, the gene sequence was first used as the analysis object, which can provide the key basic data for rodent control in Qinghai-Xizang Plateau.
【作者單位】： 中國(guó)科學(xué)院西北高原生物研究所;中國(guó)科學(xué)院大學(xué);濰坊濱海開(kāi)發(fā)區(qū)管委會(huì);青海省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院;
【基金】：青海省科技支撐計(jì)劃項(xiàng)目——青藏高原草地鼠害綜合防控技術(shù)集成與示范(2014-NS-113) 青海省科技項(xiàng)目——貴南縣退化草地恢復(fù)治理及生態(tài)畜牧業(yè)關(guān)鍵技術(shù)集成與應(yīng)用(2014-NS-118)
【分類(lèi)號(hào)】：S812.6
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，本文編號(hào)：1758642
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