本文選題：大豆 + GmIDD基因　； 參考：《大豆科學(xué)》2017年04期

【摘要】：利用NCBI和Phytozome數(shù)據(jù)庫進(jìn)行GmIDD基因的同源基因檢索,獲取該基因在大豆不同染色體中5個(gè)拷貝的序列信息。通過對(duì)功能結(jié)構(gòu)域的分析結(jié)果顯示GmIDD基因5個(gè)拷貝均含有2個(gè)C2H2型(72~92 aa、114~142 aa)、2個(gè)C2HC型(149~169 aa、176~195 aa)鋅指結(jié)構(gòu)域。GmIDD基因cDNA序列全長為1 227 bp,編碼408個(gè)氨基酸。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果顯示GmIDD基因5個(gè)拷貝中除了Glyma.14g10940和Glyma.17G228000外,其它IDD蛋白間進(jìn)化距離較遠(yuǎn),表明不同大豆IDD基因在功能上可能存在一定差異。長短日照處理下GmIDD表達(dá)量的分析結(jié)果顯示GmIDD基因受短日照誘導(dǎo)表達(dá),因此推測GmIDD可能參與大豆開花的調(diào)控過程。
[Abstract]:The homologous gene of GmIDD gene was searched by NCBI and Phytozome database, and the sequence information of 5 copies of GmIDD gene in different chromosomes of soybean was obtained.The results of functional domain analysis showed that all the 5 copies of GmIDD gene contained 2 C2H2 type 72O9a ~ (92) a ~ (114) ~ ~ (142) a ~ (1) A ~ (2) ~ (2) C2HC type 1499 ~ 169a ~ 166a ~ (176) ~ a ~ (195) a) the cDNA sequence of zinc finger domain. GmIDD gene was 1 227 BP, encoding 408 amino acids.Phylogenetic tree analysis showed that the phylogenetic distance between the other IDD proteins except Glyma.14g10940 and Glyma.17G228000 in the five copies of GmIDD gene was very long, which indicated that there might be some differences in the function of IDD gene in different soybean.The analysis of GmIDD expression under long and short sunlight showed that GmIDD gene was induced by short sunlight, so it was speculated that GmIDD might be involved in the regulation of soybean flowering.
【作者單位】： 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)大豆研究所/大豆生物學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：黑龍江省普通本科高等學(xué)校青年創(chuàng)新人才培養(yǎng)計(jì)劃(UNPYSCT-2015003) 國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃“七大農(nóng)作物育種”重點(diǎn)專項(xiàng)(2016YFD0101005) 轉(zhuǎn)基因生物新品種培育科技重大專項(xiàng)(2016ZX08004-005) 黑龍江省自然科學(xué)基金(C2015009) 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)“學(xué)術(shù)骨干”(16XG03) 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)2016年大學(xué)生SIPT計(jì)劃(201610224141) “十二五”農(nóng)村領(lǐng)域國家科技計(jì)劃課題(2013AA102602)
【分類號(hào)】：S565.1

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【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1755413