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基于16S rRNA基因的喜馬拉雅塔爾羊、巖羊和歐洲盤羊的腸道微生態(tài)研究

發(fā)布時間:2018-04-15 03:23

  本文選題:喜馬拉雅塔爾羊 + 巖羊; 參考:《曲阜師范大學》2017年碩士論文


【摘要】:本研究中的三種羊亞科動物包括:喜馬拉雅塔爾羊、歐洲盤羊和巖羊。國家Ⅰ級和Ⅱ級保護動物喜馬拉雅塔爾羊和巖羊的數(shù)量在不斷的減少,棲息地的改變與破壞使現(xiàn)存的塔爾羊數(shù)量僅500只左右,世界瀕危物種歐洲盤羊的數(shù)量在1000只左右。資源過度利用或盜獵,都是導致其種群大幅下降的原因。在動物的消化道中存在著數(shù)量極其龐大的微生物群落,并構建成動物體內(nèi)部最為復雜的生態(tài)系統(tǒng);消化道內(nèi)部微生物與宿主之間經(jīng)過相互作用使兩者之間發(fā)生協(xié)同進化。動物體內(nèi)微生物對生物體物質(zhì)代謝,能量傳遞,信號傳導以及動物的免疫系統(tǒng)有著重要的影響。動物腸道微生態(tài)的研究已經(jīng)在部分家養(yǎng)動物體內(nèi)展開,但對于野生物種的研究相對較少。利用二代高通量技術可以克服傳統(tǒng)分離培養(yǎng)和傳統(tǒng)分子生物學方法存在的弊端,可以對腸道微生物群落結構進行更精確的鑒定并得到系統(tǒng)的數(shù)據(jù)分析;利用二代高通量技術對塔爾羊、巖羊和歐洲盤羊的腸道微生物的研究還未見報道。本研究利用采自青海西寧野生動物園和山東濟南動物園的巖羊8只,歐洲盤羊9只,喜馬拉雅塔爾羊11只作為研究對象,對其腸道微生物16S rRNA基因序列進行擴增,構建小片段文庫并進行雙末端高通量測序,共得到超過185萬條非嵌合體序列。以97%的序列一致性將得到的非嵌合體的序列進行OUTs的聚類并進行物種注釋。28個樣本平均劃出OTUs數(shù)目為1382。物種注釋結果顯示:喜馬拉雅塔爾羊腸道微生物結構分屬16個門224個屬;低海拔盤羊組分屬21門218個屬,高海拔盤羊組分屬28門298屬;低海拔巖羊組分屬17門210屬,高海拔巖羊組分屬20門246屬。按豐度排在前兩名的分別是厚壁菌門(Firmicutes)和擬桿菌門(Bacteroidetes),且厚壁菌門在研究的所有樣本中豐度占比均在50%以上,占絕對優(yōu)勢。擬桿菌門與厚壁菌門豐度占比之和均在在80%,厚壁菌門與擬桿菌門豐度占比最高的分別為梭菌目(Clostridiales)和擬桿菌目(Bacteroidales),而這兩個目與纖維素、半纖維素等粗纖維的消化密切相關。統(tǒng)計分析發(fā)現(xiàn),同一海拔同一飼養(yǎng)條件下,三種羊亞科動物的腸道微生物群落結構存在一定的差異性,喜馬拉雅塔爾羊的厚壁菌門與擬桿菌門的比值和梭菌目的豐度占比顯著高于其他兩種動物;說明塔爾羊具有比盤羊和巖羊更加高效的將草本中粗纖維轉(zhuǎn)變?yōu)闄C體可吸收并為機體提供能量的短鏈脂肪酸的能力,這也使塔爾羊具有適應更高海拔與更惡劣環(huán)境的能力。巖羊與歐洲盤羊之間的差異性并未達到顯著性的水平(P=0.064)。對塔爾羊樣本進行性別差異分析發(fā)現(xiàn),雄性樣本組較雌性樣本組的物種多樣性略高,但腸道微生物在物種多樣性和豐度上均沒有達到顯著性的差異水平。這可能是因為在相同飼養(yǎng)條件和無環(huán)境脅迫壓力下,雌雄個體腸道微生物群落結構具有趨同發(fā)展的趨勢。對采自高低海拔的盤羊和巖羊樣本分析發(fā)現(xiàn),高海拔樣本組的厚壁菌門與擬桿菌門的比值顯著高于低海拔樣本組,并且與粗纖維消化相關的梭菌目(Clostridiales)與纖維桿菌目(Fibrobacterales)豐度占比顯著高于低海拔,這說明高海拔樣本腸道微生物具有更強的消化纖維素、半纖維素等物質(zhì)的能力,使高海拔的機體獲得更多的能量適應高寒、低氧以及低能量的粗纖維的進食環(huán)境。本課題旨在從三種羊亞科動物的腸道微生物群落結構出發(fā),通過統(tǒng)計分析動物腸道微生物的菌群結構差異探究海拔、物種、性別等因素對物種腸道微生物的影響,并為三種羊亞科動物的保護提出科學依據(jù)。
[Abstract]:In this study , there are more than 185 million non - chimerized species belonging to 18 genera , 18 genera , 18 genera and 12 genera in the world . The results show that there are more than 185 million non - chives in the digestive tract of the animals . The effects of altitude , species , sex and other factors on the intestinal microorganism of species were investigated by statistical analysis of the difference of flora structure of intestinal microorganisms in animals , and scientific basis was put forward for the protection of three kinds of sheep .

【學位授予單位】:曲阜師范大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:Q93;Q95

【參考文獻】

相關期刊論文 前6條

1 胡一鳴;姚志軍;黃志文;田園;李海濱;普瓊;楊道德;胡慧建;;西藏珠穆朗瑪峰國家級自然保護區(qū)哺乳動物區(qū)系及其垂直變化[J];獸類學報;2014年01期

2 李楠楠;劉振生;王正寰;黃麗紅;;基于細胞色素b基因的中國巖羊不同地理種群遺傳差異分析[J];生態(tài)學報;2012年08期

3 黃薇;夏霖;楊奇森;馮祚建;;青藏高原獸類分布格局及動物地理區(qū)劃[J];獸類學報;2008年04期

4 石鵬君;柏映國;袁鐵錚;姚斌;范云六;周志剛;孟昆;伍寧豐;刁其玉;;應用rpoB和16S rDNA基因的變性梯度凝膠電泳技術對山羊瘤胃細菌多樣性的研究[J];微生物學報;2007年02期

5 任青峰,李香蘭,張惠玲,莫飛鴻;巖羊行為的初步研究[J];寧夏農(nóng)學院學報;1999年01期

6 王小明,李明,唐紹祥,劉志霄;春季巖羊種群生態(tài)學特征的初步研究[J];獸類學報;1998年01期

相關碩士學位論文 前1條

1 李楠楠;中國巖羊分子系統(tǒng)地理學初探[D];東北林業(yè)大學;2012年

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本文編號:1752307

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