大鯢不同發(fā)育階段及組織中內(nèi)參基因穩(wěn)定性評(píng)價(jià)
本文選題:大鯢 + 嗜水氣單胞菌。 參考:《西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版)》2017年10期
【摘要】:【目的】研究18S核糖體RNA(18SrRNA)、延伸因子1-α(EF1-α)、甘油醛-3-磷酸脫氫酶(GAPDH)、β-肌動(dòng)蛋白(β-actin)和琥珀酸脫氫酶A亞基(SDHA)等5種常見內(nèi)參基因在大鯢不同組織、不同發(fā)育階段及嗜水氣單胞菌感染下的穩(wěn)定性,為大鯢后基因組學(xué)研究提供指導(dǎo)!痉椒ā坎杉3齡健康大鯢的肝臟、腸、胃、胰腺、腎臟、肌肉、皮膚、脾臟等組織,3齡、2齡、1齡、9月齡、1周齡健康大鯢的皮膚組織及嗜水氣單胞菌感染大鯢后第3,5,7天的皮膚組織,提取其RNA,進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè),應(yīng)用3種內(nèi)參基因穩(wěn)定性評(píng)價(jià)分析工具(geNorm,NormFinder,BestKeeper)分析5種內(nèi)參基因在大鯢不同組織、不同發(fā)育階段以及不同病理狀態(tài)下的穩(wěn)定性!窘Y(jié)果】5種內(nèi)參基因在大鯢不同組織中表達(dá)穩(wěn)定性較好的是EF1-α和SDHA,而在不同發(fā)育階段及嗜水氣單胞菌感染大鯢的皮膚組織中,5種內(nèi)參基因的表達(dá)穩(wěn)定性不同于在不同組織中的表達(dá),穩(wěn)定性較好的是EF1-α和GAPDH!窘Y(jié)論】EF1-α表達(dá)最為穩(wěn)定,是大鯢定量PCR首選內(nèi)參基因,而SDHA、GAPDH以及β-actin表達(dá)穩(wěn)定性受生理狀態(tài)的影響較大,作為第二內(nèi)參基因時(shí)應(yīng)視試驗(yàn)?zāi)康亩?在不同組織中進(jìn)行定量PCR比較時(shí)應(yīng)選用SDHA,而在不同生理狀態(tài)下則應(yīng)選用GAPDH為第二或備用內(nèi)參基因。
[Abstract]:[Objective] to study the 18S ribosomal RNA (18SrRNA), elongation factor 1- alpha (EF1- alpha), glyceraldehyde -3- phosphate dehydrogenase (GAPDH), beta actin (beta -actin) and succinate dehydrogenase A subunit (SDHA) of 5 kinds of common reference genes in different tissues in different developmental stages and the stability of giant salamander, Aeromonas hydrophila under the infection, to provide guidance for the study of genome. [Methods] after the giant salamander collected 3 old healthy giant salamander's liver, intestine, stomach, pancreas, kidney, muscle, skin, spleen, 3 age, 2 age, 1 age, 9 month old, giant salamander 1 week old healthy skin tissue and hydrophila article 3,5,7 days after infection of Aeromonas davidianus skin tissue, RNA extraction by real-time fluorescence quantitative PCR detection, the application of 3 kinds of reference gene stability evaluation analysis tools (geNorm, NormFinder, BestKeeper) analysis of 5 reference genes in different groups of giant salamander weave, different developmental stages and different pathological conditions Stability. [results] 5 reference genes in different tissues in the expression of giant salamander with good stability is EF1- alpha and SDHA, and in different developmental stages of Aeromonas hydrophila and giant salamander infected skin tissues, the expression stability of 5 kinds of reference genes in different expression in different tissues, better stability of EF1- alpha [Conclusion] EF1- and GAPDH. expression of the most stable, giant salamander is the best reference genes and quantitative PCR, SDHA, GAPDH and beta -actin expression affects the stability is affected by the physiological status of the larger, second reference genes should be regarded as objective and quantitative test, PCR should be used in SDHA in different tissues, and in under different physiological conditions should be selected for the GAPDH second or alternate reference gene.
【作者單位】: 西北農(nóng)林科技大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;
【基金】:陜西省科技攻關(guān)項(xiàng)目(2012K01-18)
【分類號(hào)】:S917.4
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,本文編號(hào):1740904
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