中國(guó)六省水痘-帶狀皰疹病毒糖蛋白基因特征分析
本文選題:水痘-帶狀皰疹病毒 切入點(diǎn):糖蛋白 出處:《病毒學(xué)報(bào)》2017年02期
【摘要】:為研究中國(guó)水痘-帶狀皰疹病毒(Varicella Zoster Virus,VZV)gH(Glycoprotein H)、gK(Glycoprotein K)、gI(Glycoprotein I)糖蛋白基因特征,選取2007~2015年在中國(guó)六省收集的VZV疑似患者的皰疹液或咽拭子標(biāo)本,經(jīng)聚合酶鏈反應(yīng)(Polymerase chain reaction,PCR)方法進(jìn)行陽(yáng)性鑒定及3個(gè)糖蛋白的全基因片段擴(kuò)增,所得序列與GenBank中已公布的疫苗株及野毒株序列進(jìn)行比對(duì)分析。結(jié)果篩選出12份陽(yáng)性VZV標(biāo)本,gH、gK、gI與水痘疫苗株核苷酸和氨基酸同源性相比分別為99.8%~100%、99.8%~100%,99.8%~100%、99.6%~100%,99.9%~100%、99.7%~100%;與疫苗株相比在gH、gK、gI糖蛋白基因位點(diǎn)上12份陽(yáng)性標(biāo)本分別至少有一個(gè)核苷酸差異;與GeneBank中已報(bào)告的野毒株相比核苷酸和氨基酸同源性分別為99.6%~100%、99.3%~100%,99.7%~100%、99.3%~100%,99.7%~100%、99.7%~100%。本研究通過分析中國(guó)六省VZV糖蛋白gH、gK、gI的基因特征,發(fā)現(xiàn)這三個(gè)糖蛋白高度保守,抗原性穩(wěn)定,為了解中國(guó)水痘帶狀皰疹病毒野毒株糖蛋白本底資料,豐富基因數(shù)據(jù),從分子水平上為疫苗效果的評(píng)估、基因組學(xué)的研究提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。但中國(guó)地域遼闊,人口眾多,還需每年連續(xù)監(jiān)測(cè)并進(jìn)一步擴(kuò)大VZV病毒監(jiān)測(cè)的地域。
[Abstract]:For the study of Chinese varicella zoster virus (Varicella Zoster, Virus, VZV) gH (Glycoprotein H), gK (Glycoprotein K), gI (Glycoprotein I) glycoprotein gene characteristics, selection of 2007~2015 collected in Chinese province six suspected VZV patients with herpes or throat swab specimens, by polymerase chain reaction (Polymerase chain reaction, PCR) amplified the whole gene fragment for positive identification and 3 glycoproteins, vaccine strains and wild strains of published sequences and GenBank sequences obtained were compared and analyzed. The result showed that 12 positive specimens of VZV, gH, gK, gI compared with the varicella vaccine strain nucleotide and amino acid homology were 99.8%~100% 99.8%~100%, 99.8%~100%, 99.6%~100%, 99.9%~100%, and 99.7%~100%; compared with the vaccine strain in gH, gK, gI locus glycoprotein gene of 12 positive specimens were at least one nucleotide difference; wild strain and GeneBank have been reported Nucleotide and amino acid homology were 99.6%~100%, compared to 99.3%~100%, 99.7%~100%, 99.3%~100%, 99.7%~100%, 99.7%~100%. through the analysis of China six VZV glycoprotein gH, gK, gI genotype, and found that the three highly conserved glycoprotein, antigenic stability, in order to understand the China varicella zoster virus glycoprotein gene rich background information, the data, evaluation of vaccine effectiveness at the molecular level, and provide basic data for genomic research. But Chinese vast territory, large population, still need to further expand the VZV year continuous monitoring and virus monitoring areas.
【作者單位】: 大連醫(yī)科大學(xué);中國(guó)疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所;上海市疾病預(yù)防控制中心;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(項(xiàng)目號(hào):81302477),題目:水痘-帶狀皰疹病毒基因型在我國(guó)的分布及糖蛋白基因特征研究 國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃課題(項(xiàng)目號(hào):2016YFC1200905),題目:重要新發(fā)突發(fā)病原體應(yīng)急處置方案與規(guī)范研究
【分類號(hào)】:R373.1
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,本文編號(hào):1725470
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