本文選題：脾臟　切入點(diǎn)：差異表達(dá)　出處：《中國獸醫(yī)學(xué)報(bào)》2017年05期

【摘要】：為篩選北京油雞和來航雞脾臟組織中與抗病力差異相關(guān)的候選基因和信號(hào)通路,本研究采用高通量測(cè)序技術(shù),構(gòu)建了42日齡北京油雞(抗病力較強(qiáng))和來航雞(抗病力相對(duì)較弱)脾臟組織的數(shù)字基因表達(dá)譜,對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行了GO功能分類、KEGG信號(hào)通路分析和STRING互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建,并利用熒光定量PCR驗(yàn)證了部分差異表達(dá)基因。結(jié)果表明,以來航雞為對(duì)照組,北京油雞與之相比,差異倍數(shù)在2倍以上的共有1335個(gè)基因,其中693個(gè)上調(diào)表達(dá),643個(gè)下調(diào)表達(dá),包括多個(gè)與淋巴細(xì)胞的激活、分化和增殖、免疫器官發(fā)育等相關(guān)的基因,主要涉及到結(jié)合功能、細(xì)胞組成、細(xì)胞加工和生物學(xué)調(diào)節(jié)等功能。對(duì)通路顯著性分析發(fā)現(xiàn),與免疫相關(guān)生物學(xué)通路共有4個(gè),其中BCR信號(hào)和TLR信號(hào)涉及脾臟B細(xì)胞介導(dǎo)的體液免疫應(yīng)答反應(yīng),兩條通路上的差異表達(dá)基因構(gòu)成1個(gè)相互連接的互作網(wǎng)絡(luò),其中D79B、CD44、IL1B、SOCS1及TLR4等位于重要節(jié)點(diǎn)位置。為今后挖掘新基因和研究影響雞抗病力的遺傳因素等提供理論依據(jù)。
[Abstract]:In order to screen candidate genes and signaling pathways in spleen tissues of Beijing and Leheng chickens, high throughput sequencing technique was used in this study.The digital gene expression profiles of spleen tissues of 42-day-old Beijing fowl (with strong disease resistance) and Leheng chicken (relatively weak) were constructed, and the differential expression genes were analyzed by go functional classification and constructed by STRING interaction network.Some differentially expressed genes were verified by fluorescence quantitative PCR.The results showed that there were 1335 genes in Beijing fowl compared with the control group, 693 of them were up-regulated and 643 were down-regulated, including several genes which were related to lymphocyte activation, differentiation and proliferation.The development of immune organs and other related genes, mainly related to binding function, cell composition, cell processing and biological regulation and other functions.Significant analysis of the pathway showed that there were 4 immune-related biological pathways, in which BCR signal and TLR signal were involved in humoral immune response mediated by splenic B cells.The differentially expressed genes in the two pathways form an interlinked interaction network, in which D79BU CD44-IL1BNSOCS1 and TLR4 are located at important nodes.It provides theoretical basis for digging new genes and studying genetic factors affecting chicken disease resistance in the future.
【作者單位】： 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;河北科技師范學(xué)院;
【基金】：國家青年科學(xué)基金資助項(xiàng)目(31001003) 河北省教育廳優(yōu)秀青年科學(xué)基金資助項(xiàng)目(Y2011118) 河北省自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(C2012407009) 河北省高等學(xué)校創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)領(lǐng)軍人才培育計(jì)劃資助項(xiàng)目(LJRC004) 河北省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)攻關(guān)計(jì)劃資助項(xiàng)目(15226302D)
【分類號(hào)】：S831

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本文編號(hào)：1711948