刺五加法尼基焦磷酸合酶、鯊烯合酶、鯊烯環(huán)氧酶基因啟動(dòng)子CpG島的預(yù)測(cè)與功能驗(yàn)證
本文選題:刺五加 切入點(diǎn):啟動(dòng)子 出處:《中草藥》2017年24期
【摘要】:目的獲得刺五加法尼基焦磷酸合酶(FPS)、鯊烯合酶(SS)、鯊烯環(huán)氧酶(SE)基因啟動(dòng)子的CpG島分布情況和功能活性。方法針對(duì)已克隆的FPS、SS、SE基因啟動(dòng)子序列,使用EMBOSS和Li Lab進(jìn)行CpG島預(yù)測(cè),同時(shí)利用GUS基因作為報(bào)告基因,p CAMBIA1301質(zhì)粒作為表達(dá)載體,利用根癌農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化擬南芥進(jìn)行功能驗(yàn)證。結(jié)果發(fā)現(xiàn)刺五加FPS、SS啟動(dòng)子含有2個(gè)CpG島,長(zhǎng)度分別是520、218 bp和108、103 bp,SE啟動(dòng)子含有3個(gè)CpG島,長(zhǎng)度為290、119、149 bp。FPS、SS、SE基因啟動(dòng)子均具有啟動(dòng)活性,但強(qiáng)度不一,SS啟動(dòng)子活性最強(qiáng)。結(jié)論研究首次獲得刺五加FPS、SS、SE基因啟動(dòng)子區(qū)域的CpG島分布情況,以及其功能活性,為后續(xù)進(jìn)一步FPS、SS、SE甲基化分析及其在刺五加中的表達(dá)調(diào)控研究奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:Objective to obtain the CpG island distribution and functional activity of the promoter of FPS, squalene synthase, squalene cyclooxygenase SE) gene of Acanthopanax senticosus. Methods the CpG island was predicted by EMBOSS and Li Lab. At the same time, GUS gene was used as the expression vector of the reporter gene, and Agrobacterium tumefaciens was transformed into Arabidopsis thaliana for functional verification. The results showed that the FPSSS promoter of Acanthopanax senticosus contained two CpG islands. The length of 520218 BP and 108103 BP of the SE promoter contained three CpG islands, and the length of 290119149 BP. Conclusion the distribution of CpG island and its functional activity in the promoter region of FPS SSS SE gene of Acanthopanax senticosus were obtained for the first time. The results laid a foundation for the further study on the methylation of FPSG SSSE and its expression regulation in Acanthopanax senticosus (Acanthopanax senticosus).
【作者單位】: 華北理工大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31570683) 華北理工大學(xué)培育基金資助項(xiàng)目(SP201508);華北理工大學(xué)研究生創(chuàng)新項(xiàng)目(2017S12)
【分類號(hào)】:S567.19
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,本文編號(hào):1700583
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