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刺五加法尼基焦磷酸合酶、鯊烯合酶、鯊烯環(huán)氧酶基因啟動子CpG島的預(yù)測與功能驗證

發(fā)布時間:2018-04-02 13:22

  本文選題:刺五加 切入點:啟動子 出處:《中草藥》2017年24期


【摘要】:目的獲得刺五加法尼基焦磷酸合酶(FPS)、鯊烯合酶(SS)、鯊烯環(huán)氧酶(SE)基因啟動子的CpG島分布情況和功能活性。方法針對已克隆的FPS、SS、SE基因啟動子序列,使用EMBOSS和Li Lab進行CpG島預(yù)測,同時利用GUS基因作為報告基因,p CAMBIA1301質(zhì)粒作為表達載體,利用根癌農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化擬南芥進行功能驗證。結(jié)果發(fā)現(xiàn)刺五加FPS、SS啟動子含有2個CpG島,長度分別是520、218 bp和108、103 bp,SE啟動子含有3個CpG島,長度為290、119、149 bp。FPS、SS、SE基因啟動子均具有啟動活性,但強度不一,SS啟動子活性最強。結(jié)論研究首次獲得刺五加FPS、SS、SE基因啟動子區(qū)域的CpG島分布情況,以及其功能活性,為后續(xù)進一步FPS、SS、SE甲基化分析及其在刺五加中的表達調(diào)控研究奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:Objective to obtain the CpG island distribution and functional activity of the promoter of FPS, squalene synthase, squalene cyclooxygenase SE) gene of Acanthopanax senticosus. Methods the CpG island was predicted by EMBOSS and Li Lab. At the same time, GUS gene was used as the expression vector of the reporter gene, and Agrobacterium tumefaciens was transformed into Arabidopsis thaliana for functional verification. The results showed that the FPSSS promoter of Acanthopanax senticosus contained two CpG islands. The length of 520218 BP and 108103 BP of the SE promoter contained three CpG islands, and the length of 290119149 BP. Conclusion the distribution of CpG island and its functional activity in the promoter region of FPS SSS SE gene of Acanthopanax senticosus were obtained for the first time. The results laid a foundation for the further study on the methylation of FPSG SSSE and its expression regulation in Acanthopanax senticosus (Acanthopanax senticosus).
【作者單位】: 華北理工大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金項目(31570683) 華北理工大學(xué)培育基金資助項目(SP201508);華北理工大學(xué)研究生創(chuàng)新項目(2017S12)
【分類號】:S567.19

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本文編號:1700583

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