本文選題：甜瓜　切入點(diǎn)：幾丁質(zhì)酶　出處：《保鮮與加工》2017年04期

【摘要】：以新疆主產(chǎn)不同耐藏性的甜瓜品種伽師瓜(耐藏性好)和86-1甜瓜(新密11號,耐藏性差)為試料,利用甜瓜基因組輔助設(shè)計(jì)引物克隆幾丁質(zhì)酶基因的c DNA序列,分別對其編碼序列(CDS)及編碼氨基酸進(jìn)行相關(guān)生物信息學(xué)的預(yù)測分析,以期通過研究二者之間基因的差異揭示伽師瓜和86-1甜瓜采后不同耐藏性的機(jī)制。結(jié)果表明,獲得的伽師瓜幾丁質(zhì)酶基因(Jia Shi Melon chitinase,JSMC2),NCBI檢索號為KT921406;86-1甜瓜幾丁質(zhì)酶基因(Xin Mi-11 melon chitinase,XMMC),NCBI檢索號為KU236388。JSMC2和XMMC序列長度均為1 011 bp,包含完整的開放閱讀框,編碼336個氨基酸,與黃瓜幾丁質(zhì)酶基因具有高度的同源性。蛋白結(jié)構(gòu)域預(yù)測分析表明,甜瓜幾丁質(zhì)酶蛋白包含GH18_hevamine_Xip I_class_Ⅲ、Chi1、GH18_chitinase-like super family、Glyco-hydro-18和Glyco_18保守結(jié)構(gòu)域,可催化幾丁質(zhì)水解成N-乙酰葡糖胺,分解真菌細(xì)胞的細(xì)胞壁,抵御病原真菌的侵染。
[Abstract]:Using Jiashi melon (good storage tolerance) and 86-1 melon (Xinmi11, poor storage tolerance) mainly produced in Xinjiang as the test materials, the c DNA sequence of chitinase gene was cloned by using genomic aided design primers of muskmelon. The related bioinformatics prediction and analysis of the coding sequence CDS) and the encoded amino acids were carried out respectively, in order to reveal the mechanism of different postharvest tolerance of Jiashi melon and 86-1 melon by studying the gene differences between them. The Shi Melon chitinase gene, Shi Melon chitinase, was obtained, and its search number was KT921406 / 86-1. The search numbers of KU236388.JSMC2 and XMMC sequences were both 1 011 BP and 1 011 BP, which contained a complete open reading frame and encoded 336 amino acids. The predicted protein domain analysis showed that the muskmelon chitinase protein contains GH18_hevamine_Xip I class3, Chi1GH18chitinase-like super family Glyco-hydro-18 and Glyco_18 conserved domains, which can catalyze the hydrolysis of chitinase-like super to N-acetylglucosamine, which can catalyze the hydrolysis of chitinase to N-acetylglucosamine. The cell wall of fungal cells is broken down to resist the infection of pathogenic fungi.
【作者單位】： 新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與藥學(xué)學(xué)院;
【基金】：新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)校前期資助項(xiàng)目(XJAU201421)
【分類號】：S652

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號：1685190