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馬尾松谷胱甘肽過氧化物酶PmGPX基因的克隆及表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-03-26 00:09

  本文選題:林木育種學(xué) 切入點(diǎn):馬尾松 出處:《浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報(bào)》2017年05期


【摘要】:克隆獲得馬尾松Pinus massoniana PmGPX基因,進(jìn)行生物信息學(xué)分析以及在不同抗蟲材料表達(dá)模式分析。在前期馬尾松轉(zhuǎn)錄組測(cè)序獲得該基因片段基礎(chǔ)上,用cDNA末端快速擴(kuò)增(RACE)技術(shù)獲得基因全長(zhǎng),實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(qRT-PCR)技術(shù)分析該基因在不同抗蟲材料中的表達(dá)模式?寺~@得基因cDNA全長(zhǎng)序列,命名為PmGPX。該基因包含741 bp開放閱讀框,編碼246個(gè)氨基酸。序列分析表明:該基因具有GPX家族典型的保守結(jié)構(gòu)域,等電點(diǎn)PI 8.29,蛋白分子量27.08 kDa,與針葉植物北美云杉Picea sitchensis的同源性較高,為91%。與單子葉和雙子葉植物同源性較差,大部分在64%~80%,而在GPX家族典型保守結(jié)構(gòu)域的同源性較高,為82%~100%。qRT-PCR技術(shù)分析表明:PmGPX在所有組織中均有表達(dá),在針葉中表達(dá)量最高,嫩葉的表達(dá)量是根的33.45倍,在根、花和球果中的表達(dá)量較低,不同材料日表達(dá)模式相似,總體上隨時(shí)間出現(xiàn)"升—降—升"模式。該基因在抗蟲材料中啟動(dòng)較早,且表達(dá)量高于對(duì)照。推測(cè)該基因參與了馬尾松抗蟲防御體系。
[Abstract]:The Pinus massoniana PmGPX gene of Pinus massoniana was cloned and analyzed by bioinformatics and expression patterns of different insect-resistant materials. The full length of the gene was obtained by rapid amplification of the cDNA terminal and the expression pattern of the gene in different insect-resistant materials was analyzed by real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction (QRT-PCR). The full-length sequence of the gene was cloned and obtained. The gene is named PmGPX. the gene contains 741bp open reading frame and encodes 246 amino acids. Sequence analysis shows that the gene has a typical conserved domain of GPX family. Pi 8.29, protein molecular weight 27.08 kDa. the homology with coniferous Picea sitchensis is 91.The homology with monocotyledonous and dicotyledonous plants is poor, most of them are in the position of 80th, but the homology is higher in the typical conserved domain of GPX family. The results of 82%~100%.qRT-PCR analysis showed that: PmGPX was expressed in all tissues, the highest in needles, 33.45 times in young leaves, lower in roots, flowers and cones, and similar in daily expression patterns of different materials. As a whole, the "up-down-ascending" pattern appeared over time, and the gene started earlier in the insect-resistant materials, and its expression level was higher than that of the control. It was speculated that the gene was involved in the anti-insect defense system of Pinus massoniana (Pinus massoniana).
【作者單位】: 廣西壯族自治區(qū)林業(yè)科學(xué)研究院國(guó)家林業(yè)局馬尾松工程技術(shù)研究中心/廣西馬尾松工程技術(shù)研究中心;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(31660219) 廣西“八桂學(xué)者”專項(xiàng)經(jīng)費(fèi)資助項(xiàng)目(2011A015) 廣西自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(2014GXNSFBA118104)
【分類號(hào)】:S791.248

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本文編號(hào):1665470

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