本文選題：人類免疫缺陷病毒　切入點(diǎn)：結(jié)核桿菌　出處：《中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院學(xué)報(bào)》2017年03期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：目的分析人類免疫缺陷病毒(HIV)/結(jié)核桿菌(TB)感染者外周血基因的生物學(xué)網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機(jī)制及關(guān)鍵蛋白,為HIV/TB感染者的早期診斷和臨床治療提供新依據(jù)。方法從基因芯片公共數(shù)據(jù)庫GEO中下載了22例南非HIV感染者和22例HIV/TB感染者的外周血基因芯片數(shù)據(jù),將數(shù)據(jù)導(dǎo)入分析軟件QOE、STRING、PANTHER、GenClip等,分析兩組患者的基因表達(dá)譜、蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)、分子生物學(xué)過程、基因功能等,尋找區(qū)別兩類患者的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)基因。結(jié)果兩組患者15 529個(gè)基因的表達(dá)譜相似,44名受試者的基因表達(dá)譜具有高度關(guān)聯(lián)性;251個(gè)(1.62%)差異表達(dá)基因?qū)υ\斷HIV/TB感染具有良好的診斷能力;RPLP1是蛋白-蛋白相互作用圖譜子網(wǎng)絡(luò)的核心節(jié)點(diǎn);差異表達(dá)基因與正向調(diào)節(jié)外界刺激、細(xì)胞內(nèi)信號(hào)通路的轉(zhuǎn)導(dǎo)、中性粒細(xì)胞的遷移、人體免疫等有關(guān),主要參與自由基相關(guān)凋亡、炎性反應(yīng)等通路的活化。結(jié)論共發(fā)現(xiàn)251個(gè)差異表達(dá)的基因可將單純HIV感染和HIV/TB感染進(jìn)行區(qū)別,其中差異表達(dá)的前40個(gè)基因的蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)中所包含的RPLP1基因可能與HIV/TB感染密切關(guān)聯(lián),主要涉及正向調(diào)節(jié)外界刺激、細(xì)胞內(nèi)信號(hào)通路的轉(zhuǎn)導(dǎo)、中性粒細(xì)胞的遷移、人體免疫等生物學(xué)功能,為HIV/TB感染的診斷和治療提供了一定的參考依據(jù)。
[Abstract]:Objective to analyze the biological network regulation mechanism and key protein of peripheral blood gene in human immunodeficiency virus (HIV) infected patients with HIV / Mycobacterium tuberculosis (TB) infection. Methods the peripheral blood gene chip data of 22 South African HIV infected patients and 22 HIV/TB infected persons were downloaded from GEO, a common database of gene chips, and the data were imported into the software QOERINGPANTHERN GenClip. Analysis of gene expression profiles, protein interaction networks, molecular biological processes, gene functions, etc. Results the expression profiles of 15 529 genes in the two groups were similar to those of 44 subjects. The gene expression profiles of 44 subjects had a high correlation.) the differentially expressed genes had a good value in the diagnosis of HIV/TB infection. RPLP1 is the core node of protein-protein interaction map network. Differentially expressed genes are related to positive regulation of external stimuli, transduction of intracellular signaling pathways, neutrophil migration, human immunity and so on, and are mainly involved in free radical related apoptosis. Conclusion 251 differentially expressed genes can distinguish between HIV infection and HIV/TB infection. The RPLP1 gene contained in the protein-protein interaction network of the first 40 differentially expressed genes may be closely related to HIV/TB infection, mainly involved in positive regulation of external stimulation, transduction of intracellular signal pathway, and neutrophil migration. Human immunity and other biological functions provide a certain reference for the diagnosis and treatment of HIV/TB infection.
【作者單位】： 陜西中醫(yī)藥大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)教研室;陜西中醫(yī)藥大學(xué)第一臨床醫(yī)學(xué)院骨科;
【基金】：咸陽市科技局重點(diǎn)項(xiàng)目(2013K12-01) 陜西中醫(yī)藥大學(xué)青年基金項(xiàng)目(2015QN05)~~
【分類號(hào)】：R512.91

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本文編號(hào)：1625139