茶樹CsASR基因的克隆及其表達(dá)分析
本文選題:茶樹 切入點(diǎn):ASR基因 出處:《茶葉科學(xué)》2017年04期 論文類型:期刊論文
【摘要】:逆境脅迫影響茶樹生長(zhǎng)發(fā)育及茶葉品質(zhì),ASR(abscisic acid,stress,ripening-induced)基因在植物抗逆響應(yīng)中具有重要功能。本研究以龍井43品種茶樹為材料,從中克隆了CsASR基因的全長(zhǎng)cDNA序列、基因組序列及其啟動(dòng)子序列,分析了該基因的生物信息學(xué)特征及在組織間和不同脅迫處理下的表達(dá)模式。結(jié)果顯示,CsASR的cDNA序列全長(zhǎng)875 bp,含有546 bp的ORF序列,編碼181個(gè)氨基酸,蛋白質(zhì)分子量19.89 kD,理論等電點(diǎn)5.69;CsASR蛋白結(jié)構(gòu)序列中74.5%的序列為無序結(jié)構(gòu),是一種無序蛋白;CsASR的C-端含有ABA/WDS功能結(jié)構(gòu)域,主要定位于細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中;茶樹CsASR與海棗的ASR相似性最高,為87%,而在進(jìn)化樹中與棗的關(guān)系最近。CsASR基因含2個(gè)外顯子,第1個(gè)外顯子長(zhǎng)363 bp,第2個(gè)外顯子長(zhǎng)183 bp,內(nèi)含子較大為2 750 bp,內(nèi)含子中含7種簡(jiǎn)單重復(fù)序列和2種DNA轉(zhuǎn)座子序列。克隆獲得起始密碼子ATG上游2 554 bp的啟動(dòng)子區(qū)序列,該啟動(dòng)子上含有干旱、低溫、高溫以及ABA等相關(guān)的順式作用元件。CsASR在根中的表達(dá)量最低;ABA抑制CsASR的表達(dá),而干旱、NaCl和低溫脅迫能夠顯著上調(diào)CsASR的表達(dá)。表明CsASR基因可能與茶樹抗逆密切相關(guān)。
[Abstract]:The effects of stress stress on the growth and development of tea plants and the quality of tea were studied. The full-length cDNA sequence of CsASR gene was cloned from the stress response of tea plants. The genome sequence and its promoter sequence were analyzed. The bioinformatics characteristics of the gene and its expression patterns under different stress treatments were analyzed. The results showed that the cDNA sequence of CsASR was 875 BP in length and contained a ORF sequence of 546 BP, encoding 181 amino acids. The molecular weight of the protein was 19.89 kD, and the sequence of 74.5% in the theoretical isoelectric point of 5.69 ABA/WDS protein was disordered, and the C-terminal of the disordered protein contained ABA/WDS functional domain, which was mainly located in the cytoplasm and nucleus. The ASR similarity of tea tree CsASR and Chinese jujube was the highest (87%), while in the evolutionary tree, there were two exons in the CsASR gene. The first exon length was 363 BP, the second exon length was 183 BP, the intron was larger than 2 750 BP, and the intron contained 7 simple repeats and 2 DNA transposon sequences. The promoter sequence upstream of the start codon ATG was 2 554bp. The promoter contains drought, low temperature, high temperature and ABA related cis-acting elements. CsASR has the lowest expression in root and inhibits the expression of CsASR. However, drought stress and low temperature stress could significantly up-regulate the expression of CsASR, suggesting that CsASR gene may be closely related to the stress resistance of tea plants.
【作者單位】: 福建農(nóng)林大學(xué)園藝學(xué)院/茶學(xué)福建省高校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/中國(guó)烏龍茶協(xié)同創(chuàng)新中心;中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所/國(guó)家茶樹改良中心/農(nóng)業(yè)部茶樹生物學(xué)與資源利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(31600555) 福建省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(2017J01616) 國(guó)家茶葉產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(CARS-23)
【分類號(hào)】:Q943.2;S571.1
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,本文編號(hào):1623947
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