柑橘黃化脈明病毒的TGB基因生物信息學(xué)分析及亞細(xì)胞定位
本文選題:柑橘 切入點(diǎn):柑橘黃化脈明病毒 出處:《園藝學(xué)報(bào)》2017年08期 論文類型:期刊論文
【摘要】:柑橘黃化脈明病毒(Citrus yellow vein clearing virus,CYVCV)是一種正義單鏈RNA病毒。其基因組含有6個開放閱讀框(ORF),其中ORF2、ORF3和ORF4組成了三基因連鎖結(jié)構(gòu)(triple gene block,TGB)。以感染CYVCV的尤力克檸檬[Citrus limon(L.)Burm.f.]植株的總RNA為模板,擴(kuò)增和克隆了CYVCV的TGB基因,并開展了其編碼蛋白的理化性質(zhì)和分子特性等生物信息學(xué)分析;進(jìn)而通過In-Fusion~?技術(shù)構(gòu)建了TGB各基因的亞細(xì)胞定位載體,經(jīng)農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化洋蔥表皮細(xì)胞并在熒光顯微鏡下進(jìn)行亞細(xì)胞定位觀察。生物信息學(xué)分析結(jié)果表明,CYVCV-TGB具有與Potexvirus屬病毒TGB相似的理化性質(zhì)和分子特性,可能參與病毒在寄主中的運(yùn)動且需要外殼蛋白的參與。亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示,TGBp1定位于細(xì)胞壁(膜)上,TGBp2和TGBp3主要定位于細(xì)胞壁(膜),少量呈星點(diǎn)狀定位于細(xì)胞內(nèi)。研究結(jié)果為揭示CYVCV在寄主中的運(yùn)動機(jī)理奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:Citrus yellow vein clearing virus (CyvCVV) is a sense single-stranded RNA virus. Its genome contains six open reading frames, ORF3 and ORF4, which form a triplex gene block TGBV. The total RNA of CYVCV infected Citrus limonL.Burm.f. was used as a template. The TGB gene of CYVCV was amplified and cloned, and the physicochemical and molecular properties of its encoded protein were analyzed by bioinformatics. The subcellular localization vectors of TGB genes were constructed by using this method. Agrobacterium tumefaciens mediated transformation of onion epidermis cells and observation of subcellular localization under fluorescence microscope. Bioinformatics analysis showed that CYVCV-TGB had similar physicochemical and molecular properties as Potexvirus virus TGB. The subcellular localization results showed that TGBp1 was localized on the cell wall (membrane), TGBp2 and TGBp3 were mainly located in the cell wall (membrane), and a few of them were stellate in the cell. The results laid a foundation for revealing the mechanism of CYVCV in host.
【作者單位】: 西南大學(xué)/中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院柑桔研究所國家柑橘工程技術(shù)研究中心;
【基金】:國家公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項(xiàng)(201203076) 重慶市兩江學(xué)者計(jì)劃項(xiàng)目 重慶市基礎(chǔ)及前沿研究項(xiàng)目(CSTC2014jcyj A80033) 中央高;究蒲袠I(yè)務(wù)專項(xiàng)(XDJK2017B024)
【分類號】:S436.66
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,本文編號:1603091
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