毛竹生長素反應因子基因的生物信息學分析及差異表達
本文選題:林木育種學 切入點:毛竹 出處:《浙江農(nóng)林大學學報》2017年04期 論文類型:期刊論文
【摘要】:生長素反應因子(ARF)基因家族在植物的生長發(fā)育中起至關重要的作用。關于毛竹Phyllostachys edulis ARF基因家族在花器官中生物信息學分析未見報道。以毛竹花器官為材料,采用生物信息學的方法,對毛竹中ARF基因進行篩選,并對其系統(tǒng)進化關系、保守基序及在花器官中的差異表達模式進行了初步的分析。結果表明:毛竹全基因組中含有44個ARF基因,分為Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ類。與擬南芥Arabidopsis thaliana和水稻Oryza sativa分別比較,發(fā)現(xiàn)毛竹與水稻存在11個姐妹同源基因?qū)。此?Phe ARF13,Phe ARF14和Phe ARF35在花芽、雌蕊和幼胚中高量表達,同時Phe ARF2,Phe ARF30,Phe ARF14,Phe ARF13,Phe ARF35,Phe ARF7,Phe ARF37,Phe ARF38在雌蕊和幼胚中高量表達,推測這些基因可能在花發(fā)育和種子發(fā)育中發(fā)揮重要的作用。
[Abstract]:Auxin response factor (ARF) gene family plays a crucial role in the growth and development of plants. Phyllostachys edulis on bamboo ARF gene family in flower organ bioinformatics analysis has not been reported. In bamboo flower organ as materials, using the methods of bioinformatics, the bamboo ARF gene were screened, and the system evolution the relationship, analyzed the expression pattern of conserved motifs and differences in floral organs. The results showed that: Bamboo genome contains 44 ARF genes, divided into I, II and III respectively. Compared with Arabidopsis Arabidopsis thaliana and rice Oryza sativa, found that the bamboo and rice there are 11 sisters of homologous gene. In addition, Phe ARF13, Phe ARF14 and Phe ARF35 in flower bud, expression of pistil and embryo at the same time, Phe ARF2, Phe ARF30, Phe ARF14, Phe ARF13, Phe ARF35, Phe ARF7, Phe ARF37, Phe ARF38 in female The high expression of pistil and immature embryos suggests that these genes may play an important role in flower development and seed development.
【作者單位】: 國際竹藤中心國家林業(yè)局竹藤科學與技術重點開放實驗室;
【基金】:國家高技術研究發(fā)展計劃(“863”計劃)項目(2013AA102607-4) 國家自然科學基金資助項目(31570673)
【分類號】:S795.7
【參考文獻】
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【共引文獻】
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本文編號:1602604
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