本文選題：番茄潰瘍病菌　切入點(diǎn)：環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增　出處：《植物病理學(xué)報(bào)》2017年05期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：本研究選取番茄潰瘍病菌(Clavibacter michiganensis subsp.michiganensis,Cmm)致病島上的chpC基因的部分序列,作為環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)靶標(biāo)片段進(jìn)行LAMP引物設(shè)計(jì)。對(duì)反應(yīng)體系優(yōu)化后進(jìn)行特異性測(cè)定,結(jié)果表明供試的89株番茄潰瘍病菌中86株檢測(cè)結(jié)果為陽性,3株為陰性,供試的14株非番茄潰瘍病菌(其他重要植物病原細(xì)菌)均為陰性。檢測(cè)番茄潰瘍病菌菌懸液樣品的閾值為4.8×10~5 CFU·mL~(-1),對(duì)DNA樣品的檢測(cè)閾值為1.8×10~(-2) ng·μL~(-1),并據(jù)此建立了番茄潰瘍病菌的LAMP檢測(cè)方法。將該方法應(yīng)用于番茄種子攜帶Cmm的檢測(cè),通過提取種子浸提液樣品的總DNA,實(shí)現(xiàn)了對(duì)番茄種子攜帶Cmm的直接檢測(cè)。與普通PCR相比,該方法更加快捷簡(jiǎn)便,不依賴PCR儀等昂貴的儀器設(shè)備,可以豐富現(xiàn)有的番茄潰瘍病菌分子檢測(cè)體系,為口岸等檢疫部門提供簡(jiǎn)單易行的檢測(cè)初篩手段。
[Abstract]:This study selected tomato Canker (Clavibacter michiganensis subsp.michiganensis, Cmm) partial sequence of chpC gene of pathogenic Island, as a loop mediated isothermal amplification (loop-mediated isothermal, amplification, LAMP) target fragments were LAMP primers were designed. The optimization of the reaction system after the specific determination, the results showed that 86 positive strains detected in 89 strains the tomato canker pathogen tested, 3 strains were negative, 14 strains of non tomato canker pathogen tested (other important plant pathogenic bacteria) were negative. Detection of tomato canker bacterium suspension sample threshold is 4.8 * 10~5 CFU mL~ (-1), the detection threshold of DNA sample is 1.8 * 10~ (-2) ng - L~ (-1), and set up a LAMP method for detection of tomato canker. The method was applied to detect tomato seeds with Cmm, the total DNA extract samples by extracting seed leaching, the realization of a tomato The direct detection of Cmm is carried out. Compared with ordinary PCR, the method is more convenient and fast, and does not rely on expensive instruments such as PCR. It can enrich the existing molecular detection system of tomato canker, and provide a simple and feasible screening and screening method for port and other quarantine departments.

【作者單位】： 中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)植物病理學(xué)系種子病害檢驗(yàn)與防控北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31571972)
【分類號(hào)】：S436.412.1

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本文編號(hào)：1601805