本文選題：番茄潰瘍病菌　切入點：環(huán)介導(dǎo)等溫擴增　出處：《植物病理學(xué)報》2017年05期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：本研究選取番茄潰瘍病菌(Clavibacter michiganensis subsp.michiganensis,Cmm)致病島上的chpC基因的部分序列,作為環(huán)介導(dǎo)等溫擴增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)靶標(biāo)片段進行LAMP引物設(shè)計。對反應(yīng)體系優(yōu)化后進行特異性測定,結(jié)果表明供試的89株番茄潰瘍病菌中86株檢測結(jié)果為陽性,3株為陰性,供試的14株非番茄潰瘍病菌(其他重要植物病原細菌)均為陰性。檢測番茄潰瘍病菌菌懸液樣品的閾值為4.8×10~5 CFU·mL~(-1),對DNA樣品的檢測閾值為1.8×10~(-2) ng·μL~(-1),并據(jù)此建立了番茄潰瘍病菌的LAMP檢測方法。將該方法應(yīng)用于番茄種子攜帶Cmm的檢測,通過提取種子浸提液樣品的總DNA,實現(xiàn)了對番茄種子攜帶Cmm的直接檢測。與普通PCR相比,該方法更加快捷簡便,不依賴PCR儀等昂貴的儀器設(shè)備,可以豐富現(xiàn)有的番茄潰瘍病菌分子檢測體系,為口岸等檢疫部門提供簡單易行的檢測初篩手段。
[Abstract]:This study selected tomato Canker (Clavibacter michiganensis subsp.michiganensis, Cmm) partial sequence of chpC gene of pathogenic Island, as a loop mediated isothermal amplification (loop-mediated isothermal, amplification, LAMP) target fragments were LAMP primers were designed. The optimization of the reaction system after the specific determination, the results showed that 86 positive strains detected in 89 strains the tomato canker pathogen tested, 3 strains were negative, 14 strains of non tomato canker pathogen tested (other important plant pathogenic bacteria) were negative. Detection of tomato canker bacterium suspension sample threshold is 4.8 * 10~5 CFU mL~ (-1), the detection threshold of DNA sample is 1.8 * 10~ (-2) ng - L~ (-1), and set up a LAMP method for detection of tomato canker. The method was applied to detect tomato seeds with Cmm, the total DNA extract samples by extracting seed leaching, the realization of a tomato The direct detection of Cmm is carried out. Compared with ordinary PCR, the method is more convenient and fast, and does not rely on expensive instruments such as PCR. It can enrich the existing molecular detection system of tomato canker, and provide a simple and feasible screening and screening method for port and other quarantine departments.

【作者單位】： 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)植物病理學(xué)系種子病害檢驗與防控北京市重點實驗室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(31571972)
【分類號】：S436.412.1

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本文編號：1601805