基因芯片篩選原發(fā)性肝癌患者的差異表達基因
本文選題:肝癌 切入點:基因表達譜 出處:《河南醫(yī)學研究》2016年03期 論文類型:期刊論文
【摘要】:目的利用基因表達譜芯片技術探討原發(fā)性肝癌(PHC)不同階段(癌組織、癌旁組織、正常組織)差異基因的表達,進一步尋找PHC不同階段組織中的差異表達基因。方法提取20例肝癌癌組織、癌旁組織和正常組織的總RNA,應用Agilent人類全基因組4×44K基因芯片篩選差異表達基因,采用微陣列類分析(SAS)軟件對芯片圖像進行分析。結果篩選出癌組織與正常組織差異基因4 175個,其中上調(diào)基因1 850個,下調(diào)基因2 325個。對篩選出的差異基因進行GO分類,主要分為催化活性、信號轉導、酶活性調(diào)節(jié)、轉錄活性調(diào)節(jié)、蛋白運輸功能、細胞生長、凋亡等功能過程。結論利用基因芯片技術可高通量地篩選出PHC不同階段組織的差異表達基因,為進一步闡明PHC的發(fā)生機制提供實驗依據(jù)。
[Abstract]:Objective to investigate the differentially expressed genes at different stages (cancer tissues, adjacent tissues, normal tissues) of primary hepatocellular carcinoma (PHC) by using gene expression microarray technique. Methods Total RNAs of 20 cases of HCC tissues, adjacent tissues and normal tissues were extracted, and the differentially expressed genes were screened by 4 脳 44K gene chip in the whole human genome of Agilent. Microarray analysis software was used to analyze the microarray image. Results 4,175 differentially expressed genes were screened out, including 1 850 up-regulated genes and 2 325 down-regulated genes. The differential genes were classified by go. Mainly divided into catalytic activity, signal transduction, enzyme activity regulation, transcriptional activity regulation, protein transport function, cell growth, Conclusion the differentially expressed genes in different stages of PHC can be screened with high throughput by using gene chip technique, which provides experimental basis for further elucidation of the mechanism of PHC.
【作者單位】: 新鄉(xiāng)醫(yī)學院;南陽市中心醫(yī)院普外科;
【分類號】:R735.7
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,本文編號:1591189
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