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基因芯片篩選原發(fā)性肝癌患者的差異表達(dá)基因

發(fā)布時(shí)間:2018-03-10 01:31

  本文選題:肝癌 切入點(diǎn):基因表達(dá)譜 出處:《河南醫(yī)學(xué)研究》2016年03期  論文類型:期刊論文


【摘要】:目的利用基因表達(dá)譜芯片技術(shù)探討原發(fā)性肝癌(PHC)不同階段(癌組織、癌旁組織、正常組織)差異基因的表達(dá),進(jìn)一步尋找PHC不同階段組織中的差異表達(dá)基因。方法提取20例肝癌癌組織、癌旁組織和正常組織的總RNA,應(yīng)用Agilent人類全基因組4×44K基因芯片篩選差異表達(dá)基因,采用微陣列類分析(SAS)軟件對芯片圖像進(jìn)行分析。結(jié)果篩選出癌組織與正常組織差異基因4 175個(gè),其中上調(diào)基因1 850個(gè),下調(diào)基因2 325個(gè)。對篩選出的差異基因進(jìn)行GO分類,主要分為催化活性、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、酶活性調(diào)節(jié)、轉(zhuǎn)錄活性調(diào)節(jié)、蛋白運(yùn)輸功能、細(xì)胞生長、凋亡等功能過程。結(jié)論利用基因芯片技術(shù)可高通量地篩選出PHC不同階段組織的差異表達(dá)基因,為進(jìn)一步闡明PHC的發(fā)生機(jī)制提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)。
[Abstract]:Objective to investigate the differentially expressed genes at different stages (cancer tissues, adjacent tissues, normal tissues) of primary hepatocellular carcinoma (PHC) by using gene expression microarray technique. Methods Total RNAs of 20 cases of HCC tissues, adjacent tissues and normal tissues were extracted, and the differentially expressed genes were screened by 4 脳 44K gene chip in the whole human genome of Agilent. Microarray analysis software was used to analyze the microarray image. Results 4,175 differentially expressed genes were screened out, including 1 850 up-regulated genes and 2 325 down-regulated genes. The differential genes were classified by go. Mainly divided into catalytic activity, signal transduction, enzyme activity regulation, transcriptional activity regulation, protein transport function, cell growth, Conclusion the differentially expressed genes in different stages of PHC can be screened with high throughput by using gene chip technique, which provides experimental basis for further elucidation of the mechanism of PHC.
【作者單位】: 新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院;南陽市中心醫(yī)院普外科;
【分類號】:R735.7

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