運(yùn)用線粒體COⅠ基因分析深圳海域石珊瑚系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
發(fā)布時(shí)間:2018-03-06 02:33
本文選題:石珊瑚 切入點(diǎn):COⅠ 出處:《基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)》2017年05期 論文類型:期刊論文
【摘要】:通過(guò)COⅠ基因特異擴(kuò)增測(cè)序,對(duì)深圳東部海域45種石珊瑚COⅠ基因片段序列進(jìn)行了比較分析。結(jié)果表明,該片段序列的平均(A+T)含量為61.2%,所有物種的序列堿基(A+T)含量大于(G+C)含量,與其它無(wú)脊椎動(dòng)物線粒體DNA序列基本一致,序列都處于高度飽和的狀態(tài)。45種造礁珊瑚的平均遺傳距離為0.126。采用鄰位連接(NJ)、最大似然(ML)和最小進(jìn)化(ME)法對(duì)本研究中45種石珊瑚COⅠ基因片段構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)果顯示45個(gè)石珊瑚品種分別聚為兩個(gè)大的分支,木珊瑚科、濱珊瑚科、菌珊瑚科、枇杷珊瑚科、鹿角珊瑚科的18個(gè)品種聚為分支Ⅰ,蜂巢珊瑚科、鐵星珊瑚科、梳狀珊瑚科、裸肋珊瑚科、褶葉珊瑚科的27個(gè)品種聚為分支Ⅱ,處于進(jìn)化樹基部。分支Ⅱ的聚類結(jié)果與傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)分類存在巨大差異,提示石珊瑚表型的變異性可能對(duì)傳統(tǒng)分類存在影響。
[Abstract]:By specific amplification and sequencing of CO 鈪,
本文編號(hào):1572976
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