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黃瓜單性結(jié)實候選基因預(yù)測與表達分析

發(fā)布時間:2018-03-04 13:44

  本文選題:黃瓜 切入點:單性結(jié)實 出處:《核農(nóng)學(xué)報》2016年02期  論文類型:期刊論文


【摘要】:為發(fā)掘黃瓜單性結(jié)實基因并通過表達分析預(yù)測相關(guān)基因的功能,以黃瓜單性結(jié)實性狀QTL定位結(jié)果為基礎(chǔ),對主效QTL區(qū)段內(nèi)的基因進行生物信息學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)118個基因與細胞周期、細胞生長以及激素信號傳導(dǎo)等生物學(xué)過程有關(guān)。結(jié)合黃瓜單性結(jié)實轉(zhuǎn)錄組研究結(jié)果,共篩選出10個在黃瓜單性結(jié)實過程中轉(zhuǎn)錄水平有劇烈變化的基因。利用q RT-PCR技術(shù)分析這些基因在授粉、未授粉及單性結(jié)實的黃瓜果實發(fā)育過程中的轉(zhuǎn)錄變化,結(jié)果表明,Cs CRT1、Cs LON、Cs TRAPPC4、Cs RABEPK和Cs POT基因在單性結(jié)實坐果過程中特異性的上調(diào)表達,Cs5NG4基因在單性結(jié)實和授粉結(jié)實過程中呈相反表達趨勢,因此推測這6個基因為黃瓜單性結(jié)實候選基因。本研究為進一步利用候選基因資源改良現(xiàn)有黃瓜栽培品種的單性結(jié)實性奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:In order to explore the parthenocarpy genes of cucumber and predict the function of related genes by expression analysis, based on the results of QTL mapping of parthenocarpy traits in cucumber, bioinformatics analysis of genes in the main effect QTL region was carried out. It was found that 118 genes were related to cell cycle, cell growth and hormone signal transduction. A total of 10 genes were screened out which changed dramatically during parthenocarpy. Q RT-PCR technique was used to analyze the transcriptional changes of these genes during the development of pollinated, unpollinated and parthenocarpic cucumber fruits. The results showed that the expression of Cs5NG4 gene in parthenocarpy and pollination was reverse during parthenocarpy and fruiting. The results showed that Cs5NG4 RABEPK and Cs POT genes were up-regulated specifically during parthenocarpy and pollination, and the expression of Cs5NG4 gene was reversed during parthenocarpy and pollination. Therefore, we speculated that these 6 bases were candidate genes for parthenocarpy in cucumber. This study laid a foundation for further improvement of parthenocarpy of existing cucumber cultivars by using candidate gene resources.
【作者單位】: 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院/作物遺傳與種質(zhì)創(chuàng)新國家重點實驗室;
【基金】:國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃“973”項目(2012CB113904) 農(nóng)業(yè)部行業(yè)專項(201403032) 國家自然基金青年基金(31301781)
【分類號】:S642.2

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本文編號:1565882

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