微滴式數(shù)字PCR定量檢測轉(zhuǎn)基因玉米品系VCO-01981-5
本文選題:轉(zhuǎn)基因玉米 切入點(diǎn):品系VCO-- 出處:《食品科學(xué)》2017年12期 論文類型:期刊論文
【摘要】:建立基于QX100微滴式數(shù)字聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)平臺(tái)的我國未批準(zhǔn)轉(zhuǎn)基因玉米品系VCO-01981-5的二重微滴式數(shù)字PCR定量檢測方法。該方法選擇基因組中單拷貝的玉米內(nèi)源基因hmg和VCO-01981-5品系邊界序列為定量靶序列,分別設(shè)計(jì)不同的PCR擴(kuò)增引物和TaqMan探針,并對(duì)兩種探針用不同的熒光進(jìn)行標(biāo)記,然后將上述探針和引物置于同一個(gè)PCR反應(yīng)體系中以同時(shí)定量兩個(gè)靶標(biāo)序列。特異性實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示該法只有VCO-01981-5品系的兩個(gè)靶序列才都有擴(kuò)增信號(hào)。靈敏度、線性和準(zhǔn)確性實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示在定量結(jié)果相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)偏差不大于25%時(shí),最低可穩(wěn)定定量5個(gè)拷貝的VCO-01981-5品系特異性序列分子和4個(gè)拷貝的內(nèi)源基因hmg分子;而在高達(dá)50 ng模板DNA以下范圍內(nèi),PCR反應(yīng)模板量與測定樣品拷貝數(shù)之間呈高度正相關(guān),相關(guān)系數(shù)達(dá)0.99以上;平均誤差小于10%。結(jié)果表明本研究建立的該玉米品系定量方法特異性強(qiáng),穩(wěn)定性好,精確性、準(zhǔn)確性以及靈敏度高,定量范圍廣,可用于進(jìn)、出口農(nóng)產(chǎn)品和食品中該轉(zhuǎn)基因玉米品系成分的定量檢測。此外,該法還可為其他轉(zhuǎn)基因玉米品系及其他轉(zhuǎn)基因作物品系建立類似定量檢測方法提供參考。
[Abstract]:A double microdrop digital PCR quantitative detection method for transgenic maize strain VCO-01981-5 based on QX100 microdrop polymerase chain reactionation platform was established. The method was used to select the single copy maize endogenous gene in the genome. Because the boundary sequences of hmg and VCO-01981-5 strains are quantitative target sequences, Different PCR amplification primers and TaqMan probes were designed, and the two probes were labeled with different fluorescence. Then the probe and primer were placed in the same PCR reaction system to quantify the two target sequences simultaneously. The specificity experiment showed that only the two target sequences of the VCO-01981-5 strain had amplification signal. The results of linear and accuracy experiments showed that when the relative standard deviation of quantitative results was not greater than 25, the lowest stable quantification of 5 copies of VCO-01981-5 strain specific sequence molecules and 4 copies of endogenous gene hmg molecules; However, within the range of up to 50 ng template DNA, there was a highly positive correlation between the amount of template and the copy number of the sample, the correlation coefficient was more than 0.99, and the average error was less than 10%. The results showed that the quantitative method established in this study had strong specificity. Good stability, accuracy, accuracy and sensitivity, a wide range of quantification, can be used to import and export agricultural products and food components of the transgenic corn strain quantitative detection. The method can also be used as a reference for the establishment of similar quantitative detection methods for other transgenic maize lines and other transgenic crop lines.
【作者單位】: 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)茶與食品科技院茶樹生物學(xué)與資源利用國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;深圳出入境檢驗(yàn)檢疫局動(dòng)植物檢驗(yàn)檢疫技術(shù)中心;深圳市檢驗(yàn)檢疫科學(xué)研究院;
【基金】:公益性行業(yè)(質(zhì)檢)科研專項(xiàng)(201410014-2) 深圳市基礎(chǔ)研究計(jì)劃項(xiàng)目(JC201105190969A) 國家質(zhì)檢總局科技司項(xiàng)目(2009IK257)
【分類號(hào)】:S513
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,本文編號(hào):1564945
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