本文選題：肝癌高發(fā)家系　切入點：一級親屬　出處：《福建醫(yī)科大學(xué)》2016年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：目的:篩查福建肝癌高發(fā)家系肝癌患者、患者一級親屬與正常對照組的亞畸變?nèi)旧w及差異基因,并通過聚類分析定位基因產(chǎn)物功能。方法:采血抽提肝癌高發(fā)家系肝癌組、患者一級親屬組、健康對照組基因組,采用高分辨率微陣列比較基因雜交技術(shù)(array-CGH)進(jìn)行全基因組掃描,篩查出亞畸變?nèi)旧w及差異基因,應(yīng)用GORILLA在線分析軟件對差異基因進(jìn)行聚類分析。結(jié)果:染色體亞畸變及基因差異:肝癌組、親屬組、對照組均有不同程度的DNA拷貝數(shù)差異(擴(kuò)增和缺失),共檢查出亞畸變?nèi)旧w區(qū)段86處,涉及206個差異基因。各組間染色體平均擴(kuò)增數(shù)及缺失數(shù)差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.945)。染色體擴(kuò)增和缺失頻率在三組間的差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05)。差異基因頻率在三組間的差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05)。聚類分析結(jié)果:206個差異基因進(jìn)行聚類分析后,其中31個基因存在顯著富集,分別為APOBEC3A、APOBEC3B、DEFB103A、DEFB103B、DEFB104A、DEFB104B、DEFB105A、DEFB105B、DEFB106A、DEFB106B、DEFB107A、DEFB107B、NPY4R、OR11H12、OR11H2、OR2T10、OR2T11、OR2T34、OR2T35、OR4C6、OR4K1、OR4K2、OR4K5、OR4M1、OR4M2、OR4N2、OR4N4、OR4P4、OR4Q3、OR4S2、ZDHHC11。上述差異基因主要存在于細(xì)胞膜部分;分子功能上表現(xiàn)為G蛋白偶聯(lián)受體活性、跨膜受體活性、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、嗅覺受體活性、分子轉(zhuǎn)導(dǎo)活性;在生物學(xué)過程中與G蛋白偶聯(lián)受體信號通路、對化學(xué)刺激的感知、對刺激的感知、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、嗅覺感知、調(diào)控細(xì)胞過程、調(diào)節(jié)生物進(jìn)程等相關(guān)。其中GO:0004930(P=1.43E-10)和GO:0007186(P=3.95E-10)富集最為顯著。結(jié)論:(1)肝癌患者存在明顯的染色體擴(kuò)增和缺失,且部分染色體亞畸變是非隨機(jī)的(頻率超過10%被認(rèn)為是非隨機(jī)位點);(2)本研究中染色體亞畸變及差異基因與福建肝癌高發(fā)家系肝癌的發(fā)生無顯著相關(guān)性;(3)G蛋白偶聯(lián)受體及其介導(dǎo)的信號通路可能與福建原發(fā)性肝癌的發(fā)生、發(fā)展有關(guān)。
[Abstract]:Objective: to screen subaberrant chromosomes and differentially expressed genes between first-degree relatives and normal controls in a family with high incidence of liver cancer in Fujian Province, and to locate the function of gene products by cluster analysis. The first degree relatives of the patients and the healthy control group were scanned by high-resolution microarray comparative gene hybridization technique to screen subaberrant chromosomes and differential genes. GORILLA online analysis software was used to cluster analysis of differential genes. Results: chromosome subaberration and gene difference: liver cancer group, relatives group, In the control group, there were different DNA copy numbers to varying degrees (amplification and deletion), and 86 subaberration chromosomal regions were detected. There was no significant difference in the average number of chromosomes and the number of deletions among the three groups. There was no significant difference in the frequency of chromosome amplification and deletion among the three groups, and there was no significant difference in the frequency of chromosome amplification and deletion among the three groups. The difference in the frequency of the differentially expressed genes among the three groups was not significant. The results of cluster analysis showed that 206 differentially expressed genes were analyzed by cluster analysis. Among them, 31 genes were significantly enriched, namely APOBEC3B3DEFB103AB103A, DEFB104ADEFB104ADEFB105ADEFB105ADEFB105ADEFB105ADEFB105ADEFB106ADEFB106ADEFB107BNPY107BNPY4ROR11H12H2OR2T10OR2T10OR2T32OR2T3OR2T3OR4C6OR4K4K2OR4K1OR4M1O4N4N4N4OR4OR4OR4OR4OR4OR4Q4S2H2H2OR2OR2OR2T2T3OR2OR2OB104OR4K2OR4M4N4N4N4N4OR4OR4OR4OR4Q4S2OB107BB107BNPY4ROR11H12H2OR2T102OR2T2OR2T3OR2T3OR2OR4C6O4K4K2OR4M4M2N4N4N4OR4OR4OR4OR4OR4OR4OQ4OQ4OQ4OQ2OQ2H2OR2OR2T2OB102OR2T2OR2T3OR2T3OR2OR2T102T3OR2OR2T3OR2OR2@@. Molecular transduction activity; receptor signaling pathway coupled with G protein in biological processes, perception of chemical stimuli, perception of stimuli, signal transduction, olfactory perception, regulation of cellular processes, Regulation of biological processes, among them, the enrichment of GO0004930 (1.43E-10) and GO00071866 (Pn3.95E-10) is the most significant. Conclusion there is significant chromosome amplification and deletion in patients with liver cancer. And some chromosomal subaberrations are non-random (frequency over 10% is considered as non-random locus) in this study, there is no significant correlation between chromosomal subaberration and differential genes and the occurrence of HCC in Fujian high incidence families. Receptor and its mediated signaling pathway may be associated with the occurrence of primary liver cancer in Fujian. Development is relevant.
【學(xué)位授予單位】：福建醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：R735.7

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