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煙草PMT基因單核苷酸多態(tài)性與煙堿含量變異的研究

發(fā)布時(shí)間:2018-03-01 03:30

  本文關(guān)鍵詞: 煙草 煙堿 單核苷酸多態(tài)性 出處:《分子植物育種》2017年07期  論文類型:期刊論文


【摘要】:為了解析不同煙草品種間煙堿含量差異的遺傳機(jī)制,深入探索煙堿表型變異與基因序列多樣性之間的關(guān)系。本研究從29份烤煙品種全基因組重測(cè)序所揭示的基因組序列變異中,分析了普通煙草種4個(gè)PMT基因家族基因的SNP和Indel變異,篩選錯(cuò)義突變位點(diǎn)。發(fā)現(xiàn)在NtPMT2基因第1個(gè)外顯子的第75個(gè)堿基處存在1個(gè)錯(cuò)義SNP位點(diǎn)C23_49502707,在供試群體存在G和T兩種等位變異。結(jié)合8個(gè)環(huán)境點(diǎn)的煙堿表型鑒定,可知在顯著水平上T基因型等位變異供試品種的煙堿平均含量比G基因型的高14.7%,是高煙堿優(yōu)異等位變異。進(jìn)而對(duì)該位點(diǎn)進(jìn)行了PCR標(biāo)記轉(zhuǎn)化,并篩選到1對(duì)擴(kuò)增穩(wěn)定、帶型清晰的功能標(biāo)記。本研究為克隆煙堿含量調(diào)控相關(guān)基因奠定了良好的實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ),為高煙堿品種的分子標(biāo)記輔助選擇提供了可用的標(biāo)記和基因資源。
[Abstract]:In order to elucidate the genetic mechanism of nicotine content differences among different tobacco varieties and to explore the relationship between nicotine phenotypic variation and gene sequence diversity, this study was carried out in 29 flue-cured tobacco varieties revealed by genome re-sequencing. The SNP and Indel mutations of four PMT gene family genes in common tobacco species were analyzed. A missense SNP locus C2349502707 was found at the 75th base of exon 1 of NtPMT2 gene, and there were two allelic variations G and T in the tested population. The results showed that the average content of nicotine in T genotype allelic variation was 14.7% higher than that in G genotype, and it was highly nicotinic excellent allelic variation. The PCR marker transformation of this locus was carried out, and a stable amplification pair was screened out. This study laid a good experimental foundation for cloning the genes related to the regulation of nicotine content and provided useful markers and gene resources for molecular marker-assisted selection of high-nicotine varieties.
【作者單位】: 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院煙草研究所中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院煙草遺傳改良與生物技術(shù)重點(diǎn)開(kāi)放實(shí)驗(yàn)室;中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院研究生院;蒼溪縣扶貧互助社管理辦公室;
【基金】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程(ASTIP-TRIC01);中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院煙草研究所青年科學(xué)基金(2015A01)共同資助 國(guó)家煙草專賣局煙草基因組計(jì)劃重大專項(xiàng)(110201301008)
【分類號(hào)】:S572

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):1550226

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